Von Krankenakten zu Proteinen: Datenbanken für biomedizinische Daten und ihre Bedeutung für die For
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Description

Willkommen im Seminar zu biomedizinischen Datenbanken!

Wir treffen uns immer freitags, 10-12 Uhr im T9, SR 006.

Falls wir einzelne Seminare online streamen, nutzen wir diesen Meetingraum: https://fu-berlin.webex.com/fu-berlin/j.php?MTID=m28396d6634fc5321ee742fe1f8e407cf

Sie finden die Folien zur Vorsprechung mit der Vorstellung der möglichen Themen und Hinweisen zu den Anforderungen des Kurses nun in den Ressourcen im Whiteboard, genauso wie auch die zugehörigen pdfs der Literatur. Weiterhin sind die ersten Themen und Termine schon vergeben (siehe Tabelle unten; zT noch unter Planung).

Die Folien zur Einführung ins maschinelle Lernen finden Sie auch in den Ressourcen.

Achtung: Jede Datenbank soll am Ende des Vortrags im Kurs von allen Teilnehmenden vor Ort für die Beantwortung einer Frage benutzt werden (das Setup bereitet jeweils die vortragende Person vor) - bringen Sie also Ihren Laptop mit!

Bachelorstudierende können an diesem Seminar teilnehmen, aber Inhalte sind sehr fortgeschritten und stammen weitestgehend aus aktueller Forschung. Grundlegende Literatur ist auf Englisch, daher sind gute Englischkenntnise erforderlich.

Bitte melden Sie sich gern bei Fragen persönlich (im Seminar, oder (oft) im T9, R. 161) oder per Mail (katharina.baum@fu-berlin.de)!

 

Terminplanung

Datum Thema Vortragende Person
19.4.2024 Einführung ins maschinelle Lernen Katharina Baum
26.4.2024 7. Protein Data Bank Julius Ahl
3.5.2024 entfällt  
10.5.2024 12. DrugBank Fatima Azham
17.5.2024 entfällt  
24.5.2024 1. PubMed Norman Steinhoff
31.5.2024 9. disease-related genes (hybrid) Bruno Stendal
7.6.2024 entfällt  
14.6.2024 11. GDSC (hybrid) wg Erkrankung verschoben Vico Tünke
21.6.2024 8. STRING (hybrid) Tim Schmidt
28.6.2024 5. UniProt (hybrid) Maryl Sielatchom
5.7.2024 13. DrugCombDB (hybrid) Paul Schatt
12.7.2024 11. GDSC (hybrid) Vico Tünke
19.7.2024 4. TCGA &
Zusammenfassung des Seminars, plus
Input + Fragestunde zum Bericht (Struktur,
Inhalte, Verwendung von Hilfsmitteln wie ChatGPT)
Christian Perlenfein &
Katharina Baum

 

Basic Course Info

Course No Course Type Hours
19336717 Seminar/Proseminar 2

Time Span 12.04.2024 - 19.07.2024
Instructors
Katharina Baum

Study Regulation

0086c_k150 2014, BSc Informatik (Mono), 150 LPs
0086d_k135 2014, BSc Informatik (Mono), 135 LPs
0087d_k90 2015, BSc Informatik (Kombi), 90 LPs
0088d_m60 2015, MSc Informatik (Kombi), 60 LPs
0089c_MA120 2014, MSc Informatik (Mono), 120 LPs
0207b_m37 2015, MSc Informatik (Lehramt), 37 LPs
0208b_m42 2015, MSc Informatik (Lehramt), 42 LPs
0262c_MA120 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP
0458a_m37 2015, MSc Informatik (Lehramt), 37 LPs
0471a_m42 2015, MSc Informatik (Lehramt), 42 LPs
0556a_m37 2018, M-Ed Fach 1 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 37 LPs
0556b_m37 2023, M-Ed Informatik Fach 1 (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 37 LP
0557a_m42 2018, M-Ed Fach 2 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 42 LPs
0557b_m42 2023, M-Ed Informatik Fach 2 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 42 LPs
0590b_MA120 2021, MSc Data Science, 120 LP

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Main Events

Day Time Location Details
Friday 10-12 T9/SR 006 Seminarraum 2024-04-19 - 2024-07-19

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