Willkommen im Seminar zu biomedizinischen Datenbanken!

Wir treffen uns immer freitags, 10-12 Uhr im T9, SR 006.

Falls wir einzelne Seminare online streamen, nutzen wir diesen Meetingraum: https://fu-berlin.webex.com/fu-berlin/j.php?MTID=m28396d6634fc5321ee742fe1f8e407cf

Sie finden die Folien zur Vorsprechung mit der Vorstellung der möglichen Themen und Hinweisen zu den Anforderungen des Kurses nun in den Ressourcen im Whiteboard, genauso wie auch die zugehörigen pdfs der Literatur. Weiterhin sind die ersten Themen und Termine schon vergeben (siehe Tabelle unten; zT noch unter Planung).

Die Folien zur Einführung ins maschinelle Lernen finden Sie auch in den Ressourcen.

Achtung: Jede Datenbank soll am Ende des Vortrags im Kurs von allen Teilnehmenden vor Ort für die Beantwortung einer Frage benutzt werden (das Setup bereitet jeweils die vortragende Person vor) - bringen Sie also Ihren Laptop mit!

Bachelorstudierende können an diesem Seminar teilnehmen, aber Inhalte sind sehr fortgeschritten und stammen weitestgehend aus aktueller Forschung. Grundlegende Literatur ist auf Englisch, daher sind gute Englischkenntnise erforderlich.

Bitte melden Sie sich gern bei Fragen persönlich (im Seminar, oder (oft) im T9, R. 161) oder per Mail (katharina.baum@fu-berlin.de)!

 

Terminplanung

Datum Thema Vortragende Person
19.4.2024 Einführung ins maschinelle Lernen Katharina Baum
26.4.2024 7. Protein Data Bank Julius Ahl
3.5.2024 entfällt  
10.5.2024 12. DrugBank Fatima Azham
17.5.2024 entfällt  
24.5.2024 1. PubMed Norman Steinhoff
31.5.2024 9. disease-related genes (hybrid) Bruno Stendal
7.6.2024 entfällt  
14.6.2024 11. GDSC (hybrid) wg Erkrankung verschoben Vico Tünke
21.6.2024 8. STRING (hybrid) Tim Schmidt
28.6.2024 5. UniProt (hybrid) Maryl Sielatchom
5.7.2024 13. DrugCombDB (hybrid) Paul Schatt
12.7.2024 11. GDSC (hybrid) Vico Tünke
19.7.2024 4. TCGA &
Zusammenfassung des Seminars, plus
Input + Fragestunde zum Bericht (Struktur,
Inhalte, Verwendung von Hilfsmitteln wie ChatGPT)
Christian Perlenfein &
Katharina Baum