In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.
Anmeldungen bitte über die KVV-Seite ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).
Der Journal Club wird bis auf weiteres im Raum
https://fu-berlin.webex.com/meet/kreinert
stattfinden.
| Date | Talk |
|---|---|
| 04.11. | Simon Gottlieb: MSc thesis |
| 11.11. | Enrico Seiler : Results on Binning directories and thresholds |
| 18.11. | Mitra Darvish: Synchmers - An alternative to minimizers |
| 25.11. | Marcel Ehrhardt: tbd |
| 02.12. | Jörg Winkler: State of RNA finder |
| 09.12. | Svenja Mehringer: Two level Binning directories |
| 16.12. | Lydia Buntrock: state of iGenVar |
| 06.01. | Mitra Darvish: state of alignment free quantitation |
| 11.01. | |
| 18.01. | |
| 27.01. | Aasna: Spectral Jaccard Similarity: A New Approach to Estimating Pairwise Sequence Alignments |
| 03.02. | Alavi: Efficient Construction of a Complete Index for Pan-Genomics Read Alignment |
| 20.02. | Dawid: Reeindeer |
| 17.02. | Küchler: AStarix: Fast and Optimal Sequence-to-Graph Alignment |
| 24.02. | May: Lower density selection schemes via small universal hitting sets with short remaining path length |
aktuelle Publikationen aus der Forschung
Master- und PhD-Student*inn*en
| Course No | Course Type | Hours |
|---|---|---|
| 19402911 | Seminar | 2 |
| Time Span | 02.11.2020 - 22.02.2021 |
|---|---|
| Instructors |
Knut Reinert
|
| 0089c_MA120 | 2014, MSc Informatik (Mono), 120 LPs |
| 0262b_MA120 | 2012, MSc Bioinformatik (Mono), 120 LPs |
| 0262c_MA120 | 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| Monday | 14-16 | Online | 2020-11-02 - 2021-02-22 |