Inhalt:

In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.

Anmeldungen bitte über die KVV-Seite ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).

Der Journal Club wird bis auf weiteres im Raum

https://fu-berlin.webex.com/meet/kreinert

stattfinden.

Date   Talk
04.11.   Simon Gottlieb: MSc thesis
11.11.  Enrico Seiler : Results on Binning directories and thresholds 
18.11.  Mitra Darvish: Synchmers - An alternative to minimizers
25.11.  Marcel Ehrhardt: tbd
02.12.  Jörg Winkler: State of RNA finder
09.12.   Svenja Mehringer: Two level Binning directories
16.12.  Lydia Buntrock: state of iGenVar
06.01.  Mitra Darvish: state of alignment free quantitation
11.01.  
18.01.  
27.01.  Aasna: Spectral Jaccard Similarity: A New Approach to Estimating Pairwise Sequence Alignments
03.02.  Alavi: Efficient Construction of a Complete Index for Pan-Genomics Read Alignment
20.02.  Dawid: Reeindeer
17.02.  Küchler: AStarix: Fast and Optimal Sequence-to-Graph Alignment
24.02.

 May: Lower density selection schemes via small universal hitting sets with short remaining path length
Lutfi: Representation of k-mer sets using spectrum-preserving string sets

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Literatur

 

aktuelle Publikationen aus der Forschung

 

Zusätzliche Informationen

 

Zielgruppe:

Master- und PhD-Student*inn*en