Die Studentinnen und Studenten können Standardprogramme im Bereich der Sequenzanalyse selbständig benutzen. Sie kennen die verschiedenen Konzepte und sind in der Lage, ausgewählte Systeme zu bedienen und zu programmieren. Die Studentinnen und Studenten können neue Workflows konzipieren und die Ergebnisse grafisch aufbereiten.
| 10.04. | Introduction, KNIME I |
| 17.04. | KNIME II |
| 24.04. | Simple NGS pipelines with KNIME |
| 08.05. | Generating generic KNIME nodes |
| 15.05. | Simple NGS pipelines with KNIME II |
| 22.05. | Introduction Snakemake |
| 29.05 | Advanced Snakemake |
| 05.06. | Sequence analysis pipelines in Snakemake I |
| 12.06. | Sequence analysis pipelines in Snakemake II |
| 19.06. | Sequence analysis pipelines in Snakemake III |
| 26.06. | Group project |
| 03.07. | Group project II |
| 12.07. | Presentation group project |
| Course No | Course Type | Hours |
|---|---|---|
| 19400313 | Praxisseminar | 4 |
| Time Span | 10.04.2019 - 12.07.2019 |
|---|---|
| Instructors |
Sandro Andreotti
|
| 0089c_MA120 | 2014, MSc Informatik (Mono), 120 LPs |
| 0262b_MA120 | 2012, MSc Bioinformatik (Mono), 120 LPs |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| Wednesday | 10-14 | A6/017 Frontalunterrichtsraum (Bioinf) | 2019-04-10 - 2019-07-10 |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| ?? | ? - ? | Group1 | |
| ?? | ? - ? | Group2 | |
| ?? | ? - ? | Group3 |