Willkommen im Seminar zu biomedizinischen Datenbanken!
Wir treffen uns immer freitags, 10-12 Uhr im T9, SR 006.
Falls wir einzelne Seminare online streamen, nutzen wir diesen Meetingraum: https://fu-berlin.webex.com/fu-berlin/j.php?MTID=m28396d6634fc5321ee742fe1f8e407cf
Sie finden die Folien zur Vorsprechung mit der Vorstellung der möglichen Themen und Hinweisen zu den Anforderungen des Kurses nun in den Ressourcen im Whiteboard, genauso wie auch die zugehörigen pdfs der Literatur. Weiterhin sind die ersten Themen und Termine schon vergeben (siehe Tabelle unten; zT noch unter Planung).
Die Folien zur Einführung ins maschinelle Lernen finden Sie auch in den Ressourcen.
Achtung: Jede Datenbank soll am Ende des Vortrags im Kurs von allen Teilnehmenden vor Ort für die Beantwortung einer Frage benutzt werden (das Setup bereitet jeweils die vortragende Person vor) - bringen Sie also Ihren Laptop mit!
Bachelorstudierende können an diesem Seminar teilnehmen, aber Inhalte sind sehr fortgeschritten und stammen weitestgehend aus aktueller Forschung. Grundlegende Literatur ist auf Englisch, daher sind gute Englischkenntnise erforderlich.
Bitte melden Sie sich gern bei Fragen persönlich (im Seminar, oder (oft) im T9, R. 161) oder per Mail (katharina.baum@fu-berlin.de)!
Terminplanung
Datum | Thema | Vortragende Person |
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19.4.2024 | Einführung ins maschinelle Lernen | Katharina Baum |
26.4.2024 | 7. Protein Data Bank | Julius Ahl |
3.5.2024 | entfällt | |
10.5.2024 | 12. DrugBank | Fatima Azham |
17.5.2024 | entfällt | |
24.5.2024 | 1. PubMed | Norman Steinhoff |
31.5.2024 | 9. disease-related genes (hybrid) | Bruno Stendal |
7.6.2024 | entfällt | |
14.6.2024 | ||
21.6.2024 | 8. STRING (hybrid) | Tim Schmidt |
28.6.2024 | 5. UniProt (hybrid) | Maryl Sielatchom |
5.7.2024 | 13. DrugCombDB (hybrid) | Paul Schatt |
12.7.2024 | 11. GDSC (hybrid) | Vico Tünke |
19.7.2024 | 4. TCGA & Zusammenfassung des Seminars, plus Input + Fragestunde zum Bericht (Struktur, Inhalte, Verwendung von Hilfsmitteln wie ChatGPT) |
Christian Perlenfein & Katharina Baum |
Course No | Course Type | Hours |
---|---|---|
19336717 | Seminar/Proseminar | 2 |
Time Span | 12.04.2024 - 19.07.2024 |
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Instructors |
Katharina Baum
|
0086c_k150 | 2014, BSc Informatik (Mono), 150 LPs |
0086d_k135 | 2014, BSc Informatik (Mono), 135 LPs |
0087d_k90 | 2015, BSc Informatik (Kombi), 90 LPs |
0088d_m60 | 2015, MSc Informatik (Kombi), 60 LPs |
0089c_MA120 | 2014, MSc Informatik (Mono), 120 LPs |
0207b_m37 | 2015, MSc Informatik (Lehramt), 37 LPs |
0208b_m42 | 2015, MSc Informatik (Lehramt), 42 LPs |
0262c_MA120 | 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP |
0458a_m37 | 2015, MSc Informatik (Lehramt), 37 LPs |
0471a_m42 | 2015, MSc Informatik (Lehramt), 42 LPs |
0556a_m37 | 2018, M-Ed Fach 1 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 37 LPs |
0556b_m37 | 2023, M-Ed Informatik Fach 1 (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 37 LP |
0557a_m42 | 2018, M-Ed Fach 2 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 42 LPs |
0557b_m42 | 2023, M-Ed Informatik Fach 2 Informatik (Lehramt an Integrierten Sekundarschulen und Gymnasien), 42 LPs |
0590b_MA120 | 2021, MSc Data Science, 120 LP |
Day | Time | Location | Details |
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Friday | 10-12 | T9/SR 006 Seminarraum | 2024-04-19 - 2024-07-19 |