Ziel der LV:

Die Studentinnen und Studenten haben ein tieferes Verständnis für grundlegende algorithmische Konzepte im Bereich der Analyse genomischer Sequenzen vor dem Hintergrund aktueller Forschungsrichtungen der Bioinformatik und Biotechnologie. Sie verstehen verschiedene Paradigmen zur approximativen Suche, sie wissen, unter welchen Voraussetzungen bestimmte Algorithmen anderen vorzuziehen sind, und können wissenschaftliche Publikationen auf dem Gebiet entsprechend einschätzen. 

Es werden vertieft Themen aus beispielsweise folgenden Gebieten behandelt:
- Paradigmen für approximative, semiglobale Alignments (read mapping)
- Methoden zur Genomassemblierung und Metagenomassemblierung
- Methoden zum Bestimmen genetischer Variationen (SNVs, SNPs, CNVs) - Algorithmische Probleme bei der Quantifizierung mit Hilfe von NGS Daten