In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.
Anmeldungen bitte über die KVV-Seite ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).
Der Journal Club findet bis auf weiteres online statt im Raum:
https://fu-berlin.webex.com/meet/kreinert
| Date | Talk | |
|---|---|---|
| 24.10. | Vitor Piro: Progress with Ganon2 Johanna von Wachsmann: Forschungspraktikum |
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| 31.10. | Rene Rahn: Results PhD thesis
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| 07.11. | Svenja Mehringer: tbd | |
| 14.11. | Evelin Aasna: Results of Forschungspraktikum | |
| 21.11. | Remy Schwab: tbd | |
| 28.11. | Speaker sick | |
| 05.12. | Myrthe Willemsen: MetaGraph: Indexing and Analysing Nucleotide Archives at Petabase-scale | |
| 12.12. | Mitra Darvish: tbd Rene Rahn: tbd |
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| 09.01. | Pushpa Koirala: Dashing 2: genomic sketching with multiplicities and locality-sensitive hashing | |
| 16.01. | Simon Gottlieb: tbd | |
| 23.01. |
Fatemeh Almodaresi: Mantis: A Fast, Small, and Exact Large-Scale Sequence-Search Index (15:00 !!!). |
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| 30.01 | Felix Droop: Strobealign: flexible seed size enables ultra-fast and accurate read alignment |
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| 06.02. | ||
| 13.02. | Aleksander Muck: Optimal Sequence Alignment to ED-Strings |
aktuelle Publikationen aus der Forschung
Master- und PhD-Student*inn*en
| Course No | Course Type | Hours |
|---|---|---|
| 19402911 | Seminar | 2 |
| Time Span | 17.10.2022 - 13.02.2023 |
|---|---|
| Instructors |
Knut Reinert
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| 0262c_MA120 | 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP |
| 0590b_MA120 | 2021, MSc Data Science, 120 LP |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| Monday | 14-16 | A3/SR 120 | 2022-10-17 - 2023-02-13 |