In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Fortgeschrittenenpraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.
Anmeldungen bitte über die KVV-Seite ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).
| Date | Talk | |
|---|---|---|
| 25.04. | Vitor Piro: Progress with Ganon2 | |
| 02.05. |
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| 09.05. | Myrthe Willemsen: Results internship | |
| 16.05. | Evelin Aasna: Results MSc thesis | |
| 23.05. | Jörg Winkler: State of RNA finder | |
| 30.05. | Rene Rahn: Results PhD thesis | |
| 13.06. | Marcel Ehrhardt: Results PhD | |
| 20.06. | Natalie Augustin: Efficient haplotype matching and storage using the positional Burrows–Wheeler transform (PBWT) | |
| 27.06. | Remy Schwab: tbd Swetha Rose: Improving MinHash via the containment index with applications to metagenomic analysis |
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| 04.07. | Leylanur Bodur: Cuttlefish: fast, parallel and low-memory compaction of de Bruijn graphs Somayeh Mohammadi: tbd |
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| 11.07. | Namuun Battur: Sequence-specific minimizers via polar sets Patricia Scheil: findere: Fast and Precise Approximate Membership Query |
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| 18.07 | Vishnushiri Shyamsaisundar: Lossless Indexing with Counting de Bruijn Graphs Lydia Buntrock: iGenVar |
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| 25.07 | Julianus Pfeuffer: tbd |
aktuelle Publikationen aus der Forschung
Master- und PhD-Student*inn*en
| Course No | Course Type | Hours |
|---|---|---|
| 19402911 | Seminar | 2 |
| Time Span | 25.04.2022 - 18.07.2022 |
|---|---|
| Instructors |
Knut Reinert
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| 0089c_MA120 | 2014, MSc Informatik (Mono), 120 LPs |
| 0262b_MA120 | 2012, MSc Bioinformatik (Mono), 120 LPs |
| 0262c_MA120 | 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| Monday | 14-16 | T9/051 Seminarraum | 2022-04-25 - 2022-07-18 |