In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Forschungspraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.
Anmeldungen bitte über Whiteboard ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).
Der Journal Club findet online in diesem Webex Raum statt.
| Date | Talk |
|---|---|
| 23.10. | Remy Schwab: Progress PhD |
| 30.10. | Simon Gottlieb: New results for search schemes |
| 06.11. | Svenja Mehringer: tbd |
| 13.11. | Evelin Aasna: tbd |
| 20.11. |
Enrico Seiler: tbd |
| 27.11. | Arnold Tsamo-Tetou: Combined single-cell chromatin accessibility and gene expression data analysis to infer TF/Gene regulatory units in kidney disease models |
| 04.12. | Somayeh Mohammadi: tbd |
| 11.12. | Rene Rahn: PhD talk rehearsal |
| 18.12. |
Madalina Giurgiu: ecDNA |
| 08.01. | Nora Wild: Sketching methods with small window guarantee using minimum decycling sets |
| 15.01 | Frederike Wohlfarth: Fast, lightweight, and accurate metagenomic functional profiling using FracMinHash sketches |
| 22.01. | Vincent Musch: Compressed Sparse FM-Index: Fast Sequence Alignment Using Large K-Steps |
| 29.0 | Svenja Glöde: Centrifuger: lossless compression of microbial genomes for efficient and accurate metagenomic sequence classification |
| 05.02. | Weiying Wang: Meta-colored compacted de Bruijn graphs |
| 12.02. |
Zielgruppe: Master- und PhD-Student*inn*en
aktuelle Publikationen aus der Forschung
| Course No | Course Type | Hours |
|---|---|---|
| 19402911 | Seminar | 2 |
| Time Span | 23.10.2023 - 12.02.2024 |
|---|---|
| Instructors |
Knut Reinert
|
| 0262c_MA120 | 2019 (ÄO 2021), MA Bioninformatik (Mono), 120 LP |
| 0590b_MA120 | 2021, MSc Data Science, 120 LP |
| Day | Time | Location | Details |
|---|---|---|---|
| Monday | 14-16 | A3/ 024 Seminarraum | 2023-10-23 - 2024-02-12 |
Dear all,
due to an appointment, I cannot attend on Monday.
Svenja and Simon are cohosts.
Rene Rahn will practice his PhD talk.
Knut Reinert