Forschungsseminar der Arbeitsgruppe Datenintegration in den Lebenswissenschaften (Data Integration in the Life Sciences, DILiS). Auch offen für Seminarteilnahmen im Masterstudium.

Wir starten um 14:00 s.t.

Einwahl für das hybride Setting: https://fu-berlin.webex.com/fu-berlin/j.php?MTID=m458617e952766b0c6ac964f9eda39686

Seminarraum vor Ort: A6 108/109

Das Seminar bietet Raum für die Diskussion weiterführender und integrativer Datenanalysetechniken, insbesondere Vorträge und Diskussion von laufenden oder geplanten Forschungsprojekten, Neuigkeiten von Konferenzen, Besprechung aktueller Literatur und Diskussion möglicher zukünftiger Lehrformate und -inhalte, und Vorstellungen, sowie Abschlussvorträge zu Abschlussarbeiten oder Projektseminaren. Die Seminarsprache ist weitestgehend Englisch. Gern können interessierte Studierende teilnehmen und unverbindlich vorbeischauen oder ein selbst gewähltes Thema von Interesse für die Arbeitsgruppe vorstellen - bitte kontaktieren Sie mich (katharina.baum@fu-berlin.de) mit Themenvorschlägen. Achtung: Einzelne Termine können ausfallen oder verschoben werden.

Ideas for literature to discuss:
- [very very biological] alternative splicing and its effects on PPI
publications: Karakulak et al. 2023 https://doi.org/10.1093/bioadv/vbad050, Louadi et al. 2022 https://doi.org/10.1002/9783527830503.ch16

- Deist et al 2019, Simulation-assisted machine learning. OUP Bioinformatics. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz199. The authors propose to perform coarse-grained simulations with an ODE model to assess similarity between samples for ML-based prediction. Application in drug prediction with pharmacokinetic models.