Ziel der LV:
Die Studentinnen und Studenten können Standardprogramme im Bereich der Sequenzanalyse selbständig benutzen. Sie kennen die verschiedenen Konzepte und sind in der Lage, ausgewählte Systeme zu bedienen und zu programmieren. Die Studentinnen und Studenten können neue Workflows konzipieren und die Ergebnisse grafisch aufbereiten.
Course Format - ONLINE
We will use the Cisco Webex platform which is provided by the Zedat. For the first lecture we will meet in a Webex Meeting. Afterwards all course members will be added to a Webex Team for the ongoing course phase.
Work Plan (preliminary)
| 12.04 | KNIME I |
| 19.04 | KNIME II |
| 26.04 | KNIME + NGS I |
| 03.05 | KNIME + NGS II |
| 10.05. | Snakemake I |
| 17.05. | Snakemake II |
| 31.05. | Snakemake + NGS Analysis |
| 07.06. | Snakemake + NGS Analysis |
| 14.06. | Snakemake + NGS Analysis |
| 21.06. | Group Work (Part II) |
| 28.06. | Group Work (Part II) |
| 05.07. | Group Work (Part II) |
| 12.07. | Group Work (Part II) |
| tbd. | Group Work Submission (Part II) |