Inhalt:

In diesem Seminar werden aktuelle Forschungsarbeiten der Bioinformatik sowie die Fortschrittsberichte der PhD-Student*inn*en vorgestellt. Master-Student*inn*en stellen entweder einen ihnen zugewiesenen Zeitschriftenartikel oder ihre Masterarbeit vor oder sie berichten über ihr Forschungspraktikum. Credits werden nur für die Präsentation von Artikeln vergeben.

Anmeldungen bitte über Whiteboard ("Site Browser" aufrufen und nach Journal Club suchen).

Date             Talk
15.04.      
Yannek Nowatzky: Fiora: Accurate prediction of compound mass spectra from single fragmentation events
22.04.  Madalina Giurgiu: Decoil test talk
29.04.  Vincent Musch: Bericht Forschungspraktikum
06.05.  Evelin Aasna: Results DREAM stellar
13.05.

 Remy Schwab: Tetrex results
 Svenja Mehringer: New partitioning and layout for HIBF
27.05.  Myka Youngápelian: Deciphering HIV-1 Recombinant Clades in the German Population--The Public Health Perspective
03.06.   verschoben
10.06.  Felix Droop: Combining the PEX algorithm with FM‑Index optimal search schemes for long‑read mapping
17.06.  David Fischer: Finimizers: Variable-length bounded-frequency minimizers for k-mer sets
 Enrico Seiler: tbd
24.06  Helena Waldorf: Movi: a fast and cache-efficient full-text pangenome index
01.07.  Virginia Rossow: Building a Pangenome Alignment Index via Recursive Prefix-Free Parsing
 Rene Rahn: tbd 
08.07  Jakub Liu: PLA-complexity of k-mer multisets
15.07.  Dzmitry Hramyka: Sparse and skew hashing of K-mers

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Literatur

 

aktuelle Publikationen aus der Forschung

 

Zusätzliche Informationen

 

Zielgruppe:

Master- und PhD-Student*inn*en