In diesem Hauptseminar besprechen wir verschiedenste Methoden für maschinelles Lernen. Im Fokus stehen dabei Ansätze des aktiven Lernens, Abschätzungen von Unsicherheit und ihre Nutzung, sowie Methoden für Erklärungen von Modellen. Die Anwendung und Entwicklung dieser Methoden für biomedizinische Fragestellungen wird anhand aktueller Forschungsarbeiten betrachtet.
Wir werden das Seminar vornehmlich auf Englisch durchführen, natürlich können Sie Fragen auch auf Deutsch stellen.
Treffpunkt: 14:00 c.t., T9, R. 051
Erster Termin (Themenvergabe + Intro) ist der 15.4.2025.
Bachelorstudierende können an diesem Seminar teilnehmen und es als Proseminar verwenden, aber Inhalte sind sehr fortgeschritten und stammen weitestgehend aus aktueller Forschung. Grundlegende Literatur ist auf Englisch, daher sind gute Englischkenntnise erforderlich.
Bitte melden Sie sich gern bei Fragen persönlich (im Seminar, oder (oft) im T9, R. 161), per Mail (katharina.baum@fu-berlin.de), oder buchen Sie einen Sprechstundentermin hier!
Terminplanung
| Datum | Thema | Vortragende Person |
|---|---|---|
| 15.4.2025 | Introduction to the seminar topic, expectations, assignment of topics | Katharina Baum |
| 22.4.2025 | self-study: machine learning basics | video provided by K. Baum |
| 29.4.2025 | X1 - explainability with LR and RF and patient outcome prediction | Nomesh (45 + 10) |
| 6.5.2025 |
X2a - SHAP intro, types of visualizations and small application Guidelines on reports |
Lennard (30 + 10) K. Baum (20 + 10) |
| 13.5.2025 | X2b - comparing SHAP versions for drug activity prediction | Julian (45 + 10) |
| 20.5.2025 | X3 - LRP and feature relevance in breast cancer prediction with GCNs | Michael (45 + 10) |
| 27.5.2025 | X4 - Integrated gradients and drug prediction in chemical space | Xenia Krotov (45 + 10) |
| 3.6.2025 | U2 - mixture density networks for insulin sensitivity prediction | Marvin (45 + 10) |
| 10.6.2025* | A1 | Sunwoo Gim |
| 17.6.2025 | U3 - Bayesian CNN for patient outcome prediction | Matteo (30 + 10) |
| 24.6.2025 | A2 - margin sample selection and gene-variant prediction in text | Catarina (45 + 10) |
| 1.7.2025 | A3 - active learning for biomedical citation screening | maybe Nils (undecided yet) |
| 8.7.2025 | X5 | JoonSeo Oh |
| 15.7.2025 |