Achtung: ab dem 12.11.24 sind wir im T9/K040.

Komplexe Daten lassen sich oft auf natürliche Weise als Graphen modellieren. Graphen oder Netzwerke beschreiben die Interaktion zwischen Objekten und sind ein wirksames Instrument zur Darstellung von Systemen in vielen Anwendungen. Graphneuronale Netze sind neuronale Netze, die Graphstrukturen direkt verarbeiten, und haben sich in letzter Zeit als leistungsfähiges Werkzeug zur Analyse von Netzwerken und zur Vorhersage von Eigenschaften von Knoten und Verbindungen erwiesen.

Dieses Seminar bietet eine eingehende Untersuchung von Graph Neural Networks (GNNs) und deren Anwendungen in verschiedenen Bereichen, mit besonderem Schwerpunkt auf den Biowissenschaften und der Biomedizin. Wir werden zunächst die grundlegenden Konzepte und Architekturen von GNNs erörtern, darunter Graph Convolutional Networks (GCNs) und Graph Attention Networks (GATs). Zu den besprochenen Anwendungen gehören Protein-Protein-Interaktionsnetzwerke, Pharmaforschung und personalisierte Medizin. Die Studierenden werden Forschungsarbeiten lesen und präsentieren und an kritischen Diskussionen teilnehmen.

Die Sprache dieses Seminars ist Englisch. Die Studierenden sind ermutigt, auf Englisch zu präsentieren und zu diskutieren, aber Beiträge auf Deutsch sind auch möglich.


 

Agenda

Date Speaker Topic
15.10 Pascal Intro
22.10   Topic Assignment
29.10   Break
05.11 Nathan Ritter Neural Networks
12.11 Baptiste Roizard A Gentle Introduction to Graph Neural Networks
19.11 Andor Kristen Understanding Convolutions on Graphs
26.11 Helena Waldorf Graph Attention Networks
03.12 Konrad Köllmer Fast Graph Representation Learning with PyTorch Geometric
10.12 Jakub Liu GNNExplainer: Generating Explanations for Graph Neural Networks
17.12 None Canceled
24.12 None Holidays
31.12 None Holidays
07.01 Elina Samid Modeling polypharmacy side effects with graph convolutional networks
14.01 Max Alcer GraphDTA: predicting drug–target binding affinity with graph neural networks
21.01 Jessica Wong Fake news detection on social media using geometric deep learning
28.01 Sara Sheik Functional connectivity signatures of major depressive disorder
04.02 Gal·la Daviu ETA Prediction with Graph Neural Networks in Google Maps
11.02 TBA/None TBA/None