Evento

Bachelor's programme in Bioinformatics

Bachelor's programme in Bioinformatics (2010 study regulations) (0260b_k150)

Module: Computerorientierte Mathematik II (0260bA2.4)

Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211901

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

Lecture

Submod: 0260bA2.4.1

Akt: 19.05.2021 14:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 05)

Description

Inhalt:

Die Auswahl der behandelten numerischen Verfahren enthält Polynominterpolation, Newton-Cotes-Formeln zur numerische Integration und Euler-Verfahren für lineare Differentialgleichungen.

Additional information

Studierende der Mathematik (Monobachelor und Lehramt) und Bioinformatik, sowie Numerikinteressierte aus Physik, Informatik und anderen Natur- und Geisteswissenschaften.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 05

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211902

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Lasse Hinrichsen-Bischoff

Practice seminar

Submod: 0260bA2.4.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 04)

Wed, 10:00 - 12:00 (A3/019 Seminarraum)

Wed, 08:00 - 10:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 08)

Wed, 16:00 - 18:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 15)

Thu, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 06)

Mon, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 04)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

A3/019 Seminarraum

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 08

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Module: Fundamentals of Theoretical Computer Science (0086bA3.1)

Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301201

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Günther Rothe

Lecture

Submod: 0086bA3.1.1

Akt: 07.07.2021 14:00

Wed, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Mon, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Uwe Schöning, Theoretische Informatik kurzgefasst, 5. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, 2008
John E. Hopcroft, Rajeev Motwani, Jeffrey D. Ullman, Einführung in die Automatentheorie, Formale Sprachen und Komplexität, Pearson Studium, 3. Auflage, 2011
Ingo Wegener: Theoretische Informatik - Eine algorithmenorientierte Einführung, 2. Auflage, Teubner, 1999
Michael Sipser, Introduction to the Theory of Computation, 2nd ed., Thomson Course Technology, 2006
Wegener, Kompendium theoretische Informatik - Eine Ideensammlung, Teubner 1996

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 02

Günther Rothe

07.07.2021 10:00 - 12:00

Nachklausur (Räume Hs 1b und 2 und KL 29/111 Habelschwerdter Allee 45 / Rostlaube)

Günther Rothe

06.10.2021 10:00 - 12:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Günther Rothe

Practice seminar

Submod: 0086bA3.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 025/026 Seminarraum)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/046 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/051 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 06)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/053 Seminarraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (A7/SR 031)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (A7/SR 031)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/051 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/049 Seminarraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A6/SR 025/026 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/046 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 032 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/049 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Module: Database Systems (0086bA3.3)

Database Systems

LV: 19301501

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Agnès Voisard

Lecture

Submod: 0086bA3.3.1

Akt: 08.07.2021 00:09

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Tue, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Content

Database design with ERM/ERDD. Theoretical foundations of relational database systems: relational algebra, functional dependencies, normal forms. Relational database development: SQL data definitions, foreign keys and other integrity constraints, SQL as applicable language: essential language elements, embedding in programming language. Application programming; object-relational mapping. Security and protection concepts. Transaction subject, transactional guaranties, synchronization of multi user operations, fault tolerance features. Application and new developments: data warehousing, data mining, OLAP.

Project: the topics are deepened in an implementation project for student groups.

References

Alfons Kemper, Andre Eickler: Datenbanksysteme - Eine Einführung, 5. Auflage, Oldenbourg 2004
R. Elmasri, S. Navathe: Grundlagen von Datenbanksystemen, Pearson Studium, 2005

Additional information

Requirements

ALP 1 - Functional Programming
ALP 2 - Object-oriented Programming
ALP 3 - Data structures and data abstractions
OR Informatik B

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 05

Agnès Voisard

13.07.2021 14:00 - 16:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Database systems

LV: 19301502

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Nicolas Lehmann

Practice seminar

Submod: 0086bA3.3.2

Akt: 12.03.2021 16:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 02)

Fri, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 10)

Fri, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 01)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Thu, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 13)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 03)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Mon, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 18)

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 14)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 15)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 02

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 10

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 13

Nicolas Lehmann

einmal, ab 15.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 18

Nicolas Lehmann

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 14

Nicolas Lehmann

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Bachelor's programme in Bioinformatics (2012 study regulations) (0260c_k150)

Module: Computer Science B (0260cA1.2)

Computer Science B

LV: 19302101

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Max Willert

Lecture

Submod: 0260cA1.2.1

Akt: 14.09.2021 12:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 02)

Wed, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 02)

Description

The class focuses on:

Fundations of programming: imperative and object-oriented programming
Algorithms and data structures: design and implementation of data structures
theory of algorithms

We use C++ as an implementation language.

Target Audience

Students with Computer Science as a minor concentration and students of bioinformatics.

References

Goodrich, Tamassia: Data Structures and Algorithms in C++
Stroustrup: Die C++ Programmiersprache
Cormen, Leiserson, Rivest, Stein: Introduction to Algorithms
Kleinberg, Tardos: Algorithm Design
Schöning: Algorithmen - kurz gefasst

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 02

Max Willert

21.07.2021 08:00 - 10:00

Appointment series

Virtueller Raum 02

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 02

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Practice seminar for Computer Science B

LV: 19302102

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Max Willert

Practice seminar

Submod: 0260cA1.2.2

Akt: 30.03.2021 14:00

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/046 Seminarraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/046 Seminarraum)

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/049 Seminarraum)

Thu, 08:00 - 10:00 (T9/053 Seminarraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Tue, 10:00 - 12:00 (T9/051 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Thu, 08:00 - 10:00 (T9/051 Seminarraum)

Tue, 10:00 - 12:00 (T9/049 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/049 Seminarraum)

Additional appointments

Appointment series

T9/SR 006 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/046 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/046 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/053 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A6/SR 032 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/051 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Module: Mathematik für Bioinformatiker II (0260cA2.2)

Mathematics for Bioinformaticians II

LV: 19402201

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

Lecture

Submod: 0260cA2.2.1

Akt: 30.08.2021 16:00

Tue, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 01)

Wed, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 01)

Description

number systems: from natural numbers to real numbers, completeness property of the reals
polynomials: roots of polynomials, polynomial interpolation, rational functions
special functions: exponential function, logarithm, trigonometric functions
complex numbers: exponential function for complex numbers, complex roots
convergence of sequences and series, convergence of functions, continuous functions
differential calculus: derivative of a function, interpretations and applications of the derivative
intergral calculus: definite and indefinite integrals, fundamental theorem of calculus, applications
power series
Taylor series
basics of differential calculus for multivariate functions: partial derivative, gradient, Jacobi matrix
solution of simple differential equations

References

Kurt Meyberg, Peter Vachenauer: Höhere Mathematik 1, Springer-Verlag, 6.Auflage 2001
Dirk Hachenberger: Mathematik für Informatiker, Pearson 2005
Gerhard Berendt: Mathematische Grundlagen der Informatik, Band 2, B.I.-Wissenschaftsverlag; 1990
Thomas Westermann: Mathematik für Ingenieure mit Maple 1, Springer-Verlag, 4.Auflage 2005

Additional information

Target group:

Students of Bioinformatics (BSc, second semester)

Requirements:

Mathematik für Bioinformatiker I

Additional appointments

Nachklausur

Hs A (Raum B.006, 200 Pl.)

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

13.10.2021 10:00 - 12:00

Appointment series

Virtueller Raum 01

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Practice seminar for Mathematics for Bioinformaticians II

LV: 19402202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Heike Siebert

Practice seminar

Submod: 0260cA2.2.2

Akt: 09.04.2021 18:00

Fri, 12:00 - 14:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Fri, 12:00 - 14:00 ()

Thu, 08:00 - 10:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Fri, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 07)

Additional appointments

Appointment series

A3/Hs 001 Hörsaal

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Heike Siebert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 07

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Module: Computerorientierte Mathematik II (0260cA2.4)

Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211901

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

Lecture

Submod: 0260bA2.4.1

Akt: 19.05.2021 14:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 05)

Description

Inhalt:

Die Auswahl der behandelten numerischen Verfahren enthält Polynominterpolation, Newton-Cotes-Formeln zur numerische Integration und Euler-Verfahren für lineare Differentialgleichungen.

Additional information

Studierende der Mathematik (Monobachelor und Lehramt) und Bioinformatik, sowie Numerikinteressierte aus Physik, Informatik und anderen Natur- und Geisteswissenschaften.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 05

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211902

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Lasse Hinrichsen-Bischoff

Practice seminar

Submod: 0260bA2.4.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 04)

Wed, 10:00 - 12:00 (A3/019 Seminarraum)

Wed, 08:00 - 10:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 08)

Wed, 16:00 - 18:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 15)

Thu, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 06)

Mon, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 04)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

A3/019 Seminarraum

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 08

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Module: Statistics for Biosciences II (0260cA2.6)

Statistics II for biosciences

LV: 60100101

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Jochen Kruppa

Lecture

Submod: 0260cA2.6.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Description

In der Vorlesung werden die grundlegenden Methoden aus der Vorlesung „Statistik für Biowissenschaften I“ erweitert und vertieft. Weiterhin wird er starker Fokus auf die Anwendung der besprochenen statistischen Verfahren und Methoden gelegt. Nach einer kurzen orientierenden Einführung, die die Grundlagen aus "Statistik für Biowissenschaften I" und somit die beschreibende und schließende Statistik wiederholt, werden folgende Themenbereiche ausführlicher behandelt:

PCA/Cluster/Klassifizierung
Faktoranalyse
Missing Values
Einführung: Nichtparametrik, Ausreißer
Multiples Testen /Posthoc-Tests
Regression - Diagnostische Studien mit der Vertiefung logistische Regression & ROC
Regression - Überlebenszeitanalyse
Regression - Variablenselektion
Regression - Varianzanalyse (mit Messwiederholung)
Regression - Gemischte Modelle

Zu allen Themen werden wöchentlich Übungsaufgaben, viele mit Bezug zu den Lebenswissenschaften, gestellt. Die Aufgaben werden gemischt handschriftlich und mit der Statistiksoftware R bearbeitet (Bezug über https://www.r-project.org/). Ein grundlegendes Verständnis von R Programmierung wird vorausgesetzt.

Das Kurs-Material wir über Backboard (https://lms.fu-berlin.de) zur Verfügung gestellt. Sollte wegen andauernder Pandemie keine Präsenzveranstaltungen stattfinden, findet der Kurs online über Webex statt.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 31

Jochen Kruppa

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 18:00 (13 Termine)

Practice seminar for Statistics II for biosciences

LV: 60100102

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Jochen Kruppa

Practice seminar

Submod: 0260cA2.6.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 12)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 35)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 12

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 31

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 35

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Module: Molecular Biology and Biochemistry I (0260cA3.3)

Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

LV: 21601a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

Lecture

Submod: 0260cA3.3.1

Akt: 20.07.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 ()

Description

Qualifikationsziele:
Die Studentinnen und Studenten kennen die Entstehung und molekulare Struktur der wichtigsten zellulären Makromoleküle und Stoffklassen sowie ihren biologischen Kontext. Der Schwerpunkt liegt auf einem chemischen Grundverständnis des molekularen Aufbaus von Biomolekülen.

Inhalte:
Chemische und zellbiologische Grundlagen, Struktur von DNA und RNA, Replikation und Transkription, Proteinbiosynthese, Regulation der Genexpression, gentechnologische Methoden, Aminosäuren und Peptide, Proteinstruktur und Proteinfaltung, Proteom, posttranslationale Modifikationen, Methoden der Proteinforschung, Enzyme, Kohlenhydrate, Lipide und Biomembranen, Einführung in den Stoffwechsel und die Stoffwechselregulation.

Prof. Dr. H. Ewers: helge.ewers@fu-berlin.de
Prof. Dr. F. Heyd: florian.heyd@fu-berlin.de
Prof. Dr. M. Wahl: mwahl@zedat.fu-berlin.de

Additional information for students

Vertonte ppt und/oder Videokonferenz zur regulären Zeit. Entspricht Molekularbiologie und Biochemie I für Bioinformatiker.

Additional appointments

Klausur: 21601 - Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

10.08.2021 10:00 - 11:00

Nachklausur: 21601 - Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

13.09.2021 10:00 - 11:00

Appointment series

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Übungen zur Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

LV: 21601b

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

Practice seminar

Submod: 0260cA3.3.2

Akt: 12.04.2021 12:00

Wed, 10:00 - 12:00 ()

Wed, 08:00 - 10:00 ()

Wed, 10:00 - 12:00 ()

Wed, 08:00 - 10:00 ()

Description

Qualifikationsziele: Die Studentinnen und Studenten kennen die Entstehung und molekulare Struktur der wichtigsten zellulären Makromoleküle und Stoffklassen sowie ihren biologischen Kontext. Der Schwerpunkt liegt auf einem chemischen Grundverständnis des molekularen Aufbaus von Biomolekülen. Inhalte: Chemische und zellbiologische Grundlagen, Struktur von DNA und RNA, Replikation und Transkription, Proteinbiosynthese, Regulation der Genexpression, gentechnologische Methoden, Aminosäuren und Peptide, Proteinstruktur und Proteinfaltung, Proteom, posttranslationale Modifikationen, Methoden der Proteinforschung, Enzyme, Kohlenhydrate, Lipide und Biomembranen, Einführung in den Stoffwechsel und die Stoffwechselregulation. Prof. Dr. H. Ewers: helge.ewers@fu-berlin.de Prof. Dr. F. Heyd: florian.heyd@fu-berlin.de Prof. Dr. M. Wahl: mwahl@zedat.fu-berlin.de

Additional information

Die Übungen finden n.V. in kleineren Gruppen i.d.R. dienstags von 12:00 - 14:00 Uhr bzw. mittwochs von 10:00 - 12:00 Uhr Uhr statt. Die Verteilung findet im Rahmen der Vorbesprechung (s. 21601a) statt.

Additional information for students

Videokonferenz zur regulären Zeit.

Additional appointments

Appointment series

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Module: Molecular Biology and Biochemistry III (0260cA3.5)

Molekularbiologie und Biochemie III

LV: 21699a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

Lecture

Submod: 0260cA3.5.1

Akt: 29.03.2021 14:00

Fri, 10:00 - 12:00 ()

Additional information

Qualifikationsziele:
Das in Molekularbiologie und Biochemie II erlangte Grundlagenverständnis wird in den Zusammenhang komplexer biologischer Systeme gestellt. Diese sind:
Verständnis der Rezeptorvermittelten Signaltransduktion und der Regulation von Zellzyklus und Zelltod.
Verständnis der molekularbiologischen und zellbiologischen Eigenschaften von metastasierenden Tumorzellen
Verständnis der Wechselwirkungen von Pathogenen, Wirtszellen und Immunsystem
Verständnis der Prinzipien der DNA-Medizin

Inhalte:
Wachstumsfaktoren, Rezeptoren und Signaltransduktion zur Regulation von Zellzyklus und Zelltod
Grundlagen der Immunologie: angeborene, erworbene Immunabwehr
Antigen-präsentierende Zellen, Effektorzellen
PAMP- und DAMP-Konzepte der Antigen-Prozessierung bei Infektion und Tumor-Bekämpfung
DNA-Medizin und Gentherapie

Additional information for students

Vorlesung für Studierende der Bioinformatik

Additional appointments

Appointment series

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

einmal, ab 16.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Übungen zu Molekularbiologie und Biochemie III

LV: 21699b

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

Practice seminar

Submod: 0260cA3.5.2

Akt: 29.03.2021 14:00

Wed, 14:00 - 16:00 ()

Additional information

Additional information for students

Übungen zu 21699a für Studierende der Bioinformatik

Additional appointments

Appointment series

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

einmal, ab 21.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Module: Medizinische Physiologie (0260cA3.7)

Medical Physiology

LV: 60100201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0260cA3.7.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar for Medical Physiology

LV: 60100211

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0260cA3.7.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Practical course for Medical Physiology

LV: 60100230

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Internship

Submod: 0260cA3.7.3

Akt: 09.03.2021 22:00

Module: Database Systems (0260cA4.1)

Database Systems

LV: 19301501

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Agnès Voisard

Lecture

Submod: 0086bA3.3.1

Akt: 08.07.2021 00:09

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Tue, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Content

Project: the topics are deepened in an implementation project for student groups.

References

Alfons Kemper, Andre Eickler: Datenbanksysteme - Eine Einführung, 5. Auflage, Oldenbourg 2004
R. Elmasri, S. Navathe: Grundlagen von Datenbanksystemen, Pearson Studium, 2005

Additional information

Requirements

ALP 1 - Functional Programming
ALP 2 - Object-oriented Programming
ALP 3 - Data structures and data abstractions
OR Informatik B

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 05

Agnès Voisard

13.07.2021 14:00 - 16:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Database systems

LV: 19301502

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Nicolas Lehmann

Practice seminar

Submod: 0086bA3.3.2

Akt: 12.03.2021 16:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 02)

Fri, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 10)

Fri, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 01)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Thu, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 13)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 03)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Mon, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 18)

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 14)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 15)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 02

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 10

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 13

Nicolas Lehmann

einmal, ab 15.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 18

Nicolas Lehmann

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 14

Nicolas Lehmann

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Module: Fundamentals of Theoretical Computer Science (0260cA4.2)

Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301201

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Günther Rothe

Lecture

Submod: 0086bA3.1.1

Akt: 07.07.2021 14:00

Wed, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Mon, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Uwe Schöning, Theoretische Informatik kurzgefasst, 5. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, 2008
John E. Hopcroft, Rajeev Motwani, Jeffrey D. Ullman, Einführung in die Automatentheorie, Formale Sprachen und Komplexität, Pearson Studium, 3. Auflage, 2011
Ingo Wegener: Theoretische Informatik - Eine algorithmenorientierte Einführung, 2. Auflage, Teubner, 1999
Michael Sipser, Introduction to the Theory of Computation, 2nd ed., Thomson Course Technology, 2006
Wegener, Kompendium theoretische Informatik - Eine Ideensammlung, Teubner 1996

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 02

Günther Rothe

07.07.2021 10:00 - 12:00

Nachklausur (Räume Hs 1b und 2 und KL 29/111 Habelschwerdter Allee 45 / Rostlaube)

Günther Rothe

06.10.2021 10:00 - 12:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Günther Rothe

Practice seminar

Submod: 0086bA3.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 025/026 Seminarraum)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/046 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/051 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 06)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/053 Seminarraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (A7/SR 031)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (A7/SR 031)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/051 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/049 Seminarraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A6/SR 025/026 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/046 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 032 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/049 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Master's programme in Bioinformatics

Master Bioinformatik (StO/PO 2012) (0262b_MA120)

Module: Research Lab (0262bA1.6)

Bioinformatics Research Internship

LV: 19400432

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Research Internship

Submod: 0262bA1.6.1

Akt: 17.06.2021 12:00

Module: Biodiversität und Evolution (0262bB1.1)

V Biodiversität und Evolution/ Biodiversity and Evolution (V)

LV: 23779a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB1.1.1

Akt: 09.04.2021 18:00

Ü Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (Ü)

LV: 23779b

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB1.1.2

Akt: 19.03.2021 20:00

S Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (S)

LV: 23779c

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB1.1.3

Akt: 22.03.2021 18:00

Module: Netzwerkanalyse (0262bB1.3)

Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Lecture

Submod: 0262bB1.3.1

Akt: 27.04.2021 18:00

Mon, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Description

Students have acquired a deeper understanding of fundamental mathematical and algorithmic concepts in the field of modeling, simulation and analysis of complex biological systems against the background of current research trends in system biology and biotechnology. They are capable of analyzing a given biological or medical problem, selecting a suitable modeling approach, independently developing a solution and assessing and communicating the results.

Content:

Topics from the following areas are considered in depth:

- Network structure analysis

- Graphical modeling

- Modeling of biochemical networks using standard differential equations

- Discrete modeling of regulatory networks

- Constraint-based modeling

- Stochastic and hybrid modeling

References

wird in der Veranstaltung bekanntgegeben.

Additional appointments

Appointment series

T9/SR 005 Übungsraum

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Practice seminar

Submod: 0262bB1.3.2

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405211

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Seminar

Submod: 0262bB1.3.3

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Module: Sequenzanalyse (0262bB1.5)

Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Lecture

Submod: 0262bB1.5.1

Akt: 16.06.2021 20:00

Tue, 12:00 - 14:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Description

Goals:

The students will gain a deeper unterstanding for basic algorithmic concepts for the analysis of genomic sequencing related to state of the art research in bioinformatics and biotechnology. They will learn various paradigms for the approximate search. They will know which algorithms should be preferred under what circumstances and are able to grasp key concepts of scientific publications related to this field.

Some examples of subjects that will be more deeply discussed:

Paradigms for approximative, semiglobal alignments (read mapping)
Methods for genomic assembly and metagenomic assembly
Methods for the identification of genetic variants (SNVs, SNPs, CNVs) - algorithmic problems of quantifying expession using NGS data

For further information go to: https://mycampus.imp.fu-berlin.de/portal

Additional appointments

Appointment series

A6/SR 032 Seminarraum

Torsten Semmler

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Practice seminar

Submod: 0262bB1.5.2

Akt: 05.05.2021 18:00

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 30)

Seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Seminar

Submod: 0262bB1.5.3

Akt: 16.06.2021 18:30

Fri, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Module: Current Issues in Cell Physiology (0262bB2.1)

Current topics in cell physiology

LV: 60100613

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Description

Block course during the semester break. Next available class: tba (all day)

Location: Charité Campus Benjamin Franklin (Steglitz, Hindenburgdamm 30), Institut für Klinische Physiologie

For further information: http://klinphys.charite.de/bioinfo/

or mail to Dorothee Günzel

Within this course you will generate structural models of proteins by homology modelling. You will develop hypotheses which amino acids should be decisive for the structure. These Hypotheses will be tested by carrying out molecular biologic experiments (such as site-directed mutagenesis by using two-step PCR). The construct will be cloned into expression vectors, transformed and amplified in bacteria, extracted, sequenced and overexpressed in cultured cells.

These cells will be analyzed in the confocal laser scanning microscope and by other techniques. The results will be evaluated and interpreted in the context of the original hypitheses.

The experimental part will be flanked by seminars introducing the theoretical background and the various techniques.

The exact program of this course depends on the actual research of the institute and is tightly connected to our actual projects.

References

Milatz S, Piontek J, Hempel C, Meoli L, Grohe C, Fromm A, Lee IM, El-Athman R, Günzel D (2017) Tight junction strand formation by claudin-10 isoforms and claudin-10a/-10b chimeras. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1405: 102-115 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28633196)

Piontek J, Winkler L, Wolburg H, Müller SL, Zuleger N, Piehl C, Wiesner B, Krause G, Blasig IE (2008) Formation of tight junction: determinants of homophilic interaction between classic claudins. FASEB J. 22: 146-158 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17761522)

Additional information

Please bring lab coat, if available!

Additional appointments

Appointment series

Module: Angewandte Sequenzanalyse (0262bB2.2)

Applied Sequence Analysis

LV: 19400313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Sandro Andreotti

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.2.1

Akt: 29.04.2021 18:00

Mon, 12:00 - 16:00 (Virtueller Raum 35)

Module: Rechnergestützte Systembiologie (0262bB2.4)

Computational Systems Biology

LV: 19400813

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Heike Siebert

Jana Wolf

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.4.1

Akt: 17.03.2021 13:00

Thu, 10:00 - 14:00 (T9/051 Seminarraum)

Module: Forschungsmodul A (0262bB3.1)

Journal Club Computational Biology

LV: 19402911

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Knut Reinert

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Description

Content:

In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students will either be assigend a paper, or present their MSc thesis plans and results, or report about their "Fortgeschrittenenpraktikum". Credits are only awarded for the presentation of papers.

Please sign up on the KVV pages (open "Site Browser" and look forJournal Club).

References

aktuelle Publikationen aus der Forschung

Additional information

Open for:

Master and PhD students

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Knut Reinert

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Computational Meta-Omics

LV: 19404811

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Thilo Muth

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

The growing interest in microbial communities is due to findings that demonstrate the influence of microorganisms on human health. For example, microbiome research investigates the role of intestinal microbiota in diseases such as diabetes and morbus

Crohn or health disorders such as food allergies and obesity. In this context, an imbalanced microbiome is associated with being the cause or the consequence of certain diseases or health disorders. In order to identify and quantify the microorganisms present in experimental samples, meta-omics analyses (e.g. metagenomics, metatranscriptomics, metaproteomics) are conducted that heavily rely on computational strategies from bioinformatics.

The main objectives of this seminar are (1) to introduce both computational and experimental meta-omics methods for analyzing single microbial and microbiome samples with a particular focus on metagenomics and metaproteomics, (2) to provide a general overview on the most commonly employed and recently proposed bioinformatics strategies in the field, and (3) to discuss the shortcomings of current meta-omics approaches in the context of microbiome research and diagnostics of bacteria and viruses.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Thilo Muth

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Large-scale phylogeny inference

LV: 19406111

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Prabhav Kalaghatgi

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 10)

Description

Description:

Advances in sequencing technology have made it possible to investigate the evolutionary dynamics of rapidly evolving pathogens such as SARS-CoV2 in unprecedented detail. Phylogeny inference is an essential step in evolutionary analysis. Thus techniques for large-scale phylogeny inference are needed if one is to study the evolution of tens of thousands of viral genomes. Students participating in this seminar will be introduced to topics such as

(i) Tree modification operations

(ii) Numerical optimization of hidden Markov models on trees

(ii) Topological correspondence between minimum spanning trees and phylogenetic trees

(iii) Evolutionary placement algorithm

Prior requirements:

Participation in the course "Phylogeny inference and applications", or any course dealing with combinatorial optimization is helpful but not necessary.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 10

Prabhav Kalaghatgi

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Pathophysiology: methods and findings

LV: 60101311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Computer-aided Drug Design - Methods and Application

LV: 60101711

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Andrea Volkamer

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 26.04.2021 18:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

Introductory seminar to computer-aided drug design, including structure- and ligand-based methods. Briefly, computer-aided drug design uses computational chemistry to discover, enhance, or study drugs and related biologically active molecules. In this seminar, the students will independently acquire knowledge about topics in the context of structural bioinformatics. Topics include homology modelling, target assessment, molecular docking, in-silico screening (molecular fingerprints, chemical similarity), ADME and toxicity predictions (QSAR, machine learning), and more.

The students can select a topic from the presented drug development pipeline and (under guidance) will collect material (papers, data and algorithms). At the end of the seminar, they will present the topic as well as an application of such.

It is advisable/helpful (but not mandatory) to attend the practical course ‘Using open source software and libraries for data analysis and computer-aided drug design’ (Volkamer, WiSe 2016/17, block seminar at the end of march) or ‘Current questions of structural bioinformatics’ (Preissner/Banerjee) before.

The set-up of the course will depend on the number of attending students. Preferably, we will have a bi-weekly meeting (half-day) till mid-June, followed by a weekly presentation round (4 dates à 2 hours) till the end of the semester.

More details will be discussed on Thursday, April 26th, 9-11:30 am, Charité, Mitte.

Additional information

For more information see: AG Volkamer - Teaching

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Andrea Volkamer

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 07)

Description

In this course, we introduce and discuss statistical inference methods for analyzing trials with small sample sizes. We hereby explore the impact of the standard assumption “N is large” and try to find an answer to the question “what means large?” The inference methods will cover estimation of treatment effects, confidence interval computations and hypothesis testing in both parametric and nonparametric models. Rank tests, bootstrap and permutation methods will be investigated in detail as approximation methods. This class aspires to learn about modern statistical tools that were designed to make accurate conclusions when sample sizes are rather small.

Course Material will be provided via Blackboard (lms.fu-berlin.de). In case of No face-to-face events the calss will also be held via Blackboard

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 07

Frank Konietschke

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 08)

Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102701

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Practice seminar for Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102702

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 09.03.2021 22:00

Module: Forschungsmodul B (0262bB3.2)

Journal Club Computational Biology

LV: 19402911

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Knut Reinert

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Description

Content:

Please sign up on the KVV pages (open "Site Browser" and look forJournal Club).

References

aktuelle Publikationen aus der Forschung

Additional information

Open for:

Master and PhD students

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Knut Reinert

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Computational Meta-Omics

LV: 19404811

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Thilo Muth

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Thilo Muth

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Large-scale phylogeny inference

LV: 19406111

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Prabhav Kalaghatgi

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 10)

Description

Description:

(i) Tree modification operations

(ii) Numerical optimization of hidden Markov models on trees

(ii) Topological correspondence between minimum spanning trees and phylogenetic trees

(iii) Evolutionary placement algorithm

Prior requirements:

Participation in the course "Phylogeny inference and applications", or any course dealing with combinatorial optimization is helpful but not necessary.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 10

Prabhav Kalaghatgi

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Pathophysiology: methods and findings

LV: 60101311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Computer-aided Drug Design - Methods and Application

LV: 60101711

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Andrea Volkamer

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 26.04.2021 18:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

More details will be discussed on Thursday, April 26th, 9-11:30 am, Charité, Mitte.

Additional information

For more information see: AG Volkamer - Teaching

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Andrea Volkamer

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 07)

Description

Course Material will be provided via Blackboard (lms.fu-berlin.de). In case of No face-to-face events the calss will also be held via Blackboard

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 07

Frank Konietschke

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 08)

Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102701

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Practice seminar for Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102702

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 09.03.2021 22:00

Master Bioinformatik (SPO 2019) (0262c_MA120)

Module: Complex Systems in Bioinformatics (0262cB1.1)

Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Lecture

Submod: 0262bB1.3.1

Akt: 27.04.2021 18:00

Mon, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Description

Content:

Topics from the following areas are considered in depth:

- Network structure analysis

- Graphical modeling

- Modeling of biochemical networks using standard differential equations

- Discrete modeling of regulatory networks

- Constraint-based modeling

- Stochastic and hybrid modeling

References

wird in der Veranstaltung bekanntgegeben.

Additional appointments

Appointment series

T9/SR 005 Übungsraum

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Practice seminar

Submod: 0262bB1.3.2

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405211

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Seminar

Submod: 0262bB1.3.3

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Module: Ethics and Policy Questions (0262cB1.3)

Ethics and Policy Questions

LV: 19405413

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Jens Peter Fürste

Lab Seminar

Submod: 0262cB1.3.1

Akt: 26.04.2021 14:00

Thu, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Module: Research Internship (0262cB1.4)

Bioinformatics Research Internship

LV: 19400432

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Research Internship

Submod: 0262bA1.6.1

Akt: 17.06.2021 12:00

Module: Current research topics in Complex Systems (0262cB1.5)

Large-scale phylogeny inference

LV: 19406111

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Prabhav Kalaghatgi

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 10)

Description

Description:

(i) Tree modification operations

(ii) Numerical optimization of hidden Markov models on trees

(ii) Topological correspondence between minimum spanning trees and phylogenetic trees

(iii) Evolutionary placement algorithm

Prior requirements:

Participation in the course "Phylogeny inference and applications", or any course dealing with combinatorial optimization is helpful but not necessary.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 10

Prabhav Kalaghatgi

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Pathophysiology: methods and findings

LV: 60101311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Computer-aided Drug Design - Methods and Application

LV: 60101711

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Andrea Volkamer

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 26.04.2021 18:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

More details will be discussed on Thursday, April 26th, 9-11:30 am, Charité, Mitte.

Additional information

For more information see: AG Volkamer - Teaching

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Andrea Volkamer

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Module: Human Evolution (0262cB1.7)

V Human Evolution

LV: 23770a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262cB1.7.1

Akt: 10.04.2021 00:00

S I Human Evolution

LV: 23770b

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262cB1.7.2

Akt: 03.03.2021 12:00

S II Human Evolution

LV: 23770c

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

PC-based Seminar

Submod: 0262cB1.7.3

Akt: 03.03.2021 12:00

Module: Current topics in cell-physiology (0262cB1.11)

Current topics in cell physiology

LV: 60100613

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Description

Block course during the semester break. Next available class: tba (all day)

Location: Charité Campus Benjamin Franklin (Steglitz, Hindenburgdamm 30), Institut für Klinische Physiologie

For further information: http://klinphys.charite.de/bioinfo/

or mail to Dorothee Günzel

These cells will be analyzed in the confocal laser scanning microscope and by other techniques. The results will be evaluated and interpreted in the context of the original hypitheses.

The experimental part will be flanked by seminars introducing the theoretical background and the various techniques.

The exact program of this course depends on the actual research of the institute and is tightly connected to our actual projects.

References

Additional information

Please bring lab coat, if available!

Additional appointments

Appointment series

Module: Computational Systems Biology (0262cB1.12)

Computational Systems Biology

LV: 19400813

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Heike Siebert

Jana Wolf

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.4.1

Akt: 17.03.2021 13:00

Thu, 10:00 - 14:00 (T9/051 Seminarraum)

Module: Data Science in the Life Sciences (0590aB2.1)

Data Science in the Life Sciences

LV: 19405606

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Eirini Ntoutsi

Seminar-style instruction

Submod: 0590aB2.1.1

Akt: 24.03.2021 20:00

Tue, 08:00 - 12:00 (Virtueller Raum 01)

Description

This course offers an introduction to various types of data and analysis techniques which are typically used in the life sciences (e.g. omics technologies). The goal is to get a deeper understanding of advanced concepts and data analytical methods in the area of life sciences.

The focus will be on the following topics:

* acquisition and pre-processing of data from the area of life sciences,
* explorative analysis techniques,
* concepts and tools for reproducible research,
* theory and practice of methods and models for the analysis of data from the life sciences (statistical inference, regression models, methods of machine learning),
* introduction to methods of big data analysis.

After successful completion of this course, participants are able to evaluate, plan and conduct investigations in the life sciences using common methods.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 01

Eirini Ntoutsi

einmal, ab 13.04.2021, 08:00 - 12:00 (14 Termine)

Projectseminar for Data Science in the Life Sciences

LV: 19405612

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Katinka Wolter

Project Seminar

Submod: 0590aB2.1.2

Akt: 24.03.2021 20:00

Tue, 14:00 - 18:00 (T9/Gr. Hörsaal)

Module: Current research topics in Data Science in Life Sciences (0262cB2.5)

Computational Meta-Omics

LV: 19404811

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Thilo Muth

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Thilo Muth

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Computer-aided Drug Design - Methods and Application

LV: 60101711

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Andrea Volkamer

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 26.04.2021 18:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

More details will be discussed on Thursday, April 26th, 9-11:30 am, Charité, Mitte.

Additional information

For more information see: AG Volkamer - Teaching

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Andrea Volkamer

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Module: Complex Data Analysis in Physiology (0262cB2.8)

Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102701

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Practice seminar for Complex Data Analysis in Physiology

LV: 60102702

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 09.03.2021 22:00

Module: Advanced Biometrical Methods (0262cB2.18)

Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Lecture

Submod: 0262bB3.1.1

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 07)

Description

Course Material will be provided via Blackboard (lms.fu-berlin.de). In case of No face-to-face events the calss will also be held via Blackboard

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 07

Frank Konietschke

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Statistical Methods for Small Sample Sizes

LV: 60102302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Frank Konietschke

Practice seminar

Submod: 0262bB3.1.3

Akt: 23.04.2021 12:00

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 08)

Module: Advanced Algorithms for Bioinformatics (0262cB3.1)

Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Lecture

Submod: 0262bB1.5.1

Akt: 16.06.2021 20:00

Tue, 12:00 - 14:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Description

Goals:

Some examples of subjects that will be more deeply discussed:

Paradigms for approximative, semiglobal alignments (read mapping)
Methods for genomic assembly and metagenomic assembly
Methods for the identification of genetic variants (SNVs, SNPs, CNVs) - algorithmic problems of quantifying expession using NGS data

For further information go to: https://mycampus.imp.fu-berlin.de/portal

Additional appointments

Appointment series

A6/SR 032 Seminarraum

Torsten Semmler

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Practice seminar

Submod: 0262bB1.5.2

Akt: 05.05.2021 18:00

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 30)

Seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Seminar

Submod: 0262bB1.5.3

Akt: 16.06.2021 18:30

Fri, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Module: Biodiversity and Evolution (0262cB3.5)

V Biodiversität und Evolution/ Biodiversity and Evolution (V)

LV: 23779a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB1.1.1

Akt: 09.04.2021 18:00

Ü Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (Ü)

LV: 23779b

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB1.1.2

Akt: 19.03.2021 20:00

S Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (S)

LV: 23779c

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB1.1.3

Akt: 22.03.2021 18:00

Module: Current research topics in Advanced Algorithms (0262cB3.7)

Journal Club Computational Biology

LV: 19402911

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Knut Reinert

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Description

Content:

Please sign up on the KVV pages (open "Site Browser" and look forJournal Club).

References

aktuelle Publikationen aus der Forschung

Additional information

Open for:

Master and PhD students

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Knut Reinert

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Large-scale phylogeny inference

LV: 19406111

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Prabhav Kalaghatgi

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 10)

Description

Description:

(i) Tree modification operations

(ii) Numerical optimization of hidden Markov models on trees

(ii) Topological correspondence between minimum spanning trees and phylogenetic trees

(iii) Evolutionary placement algorithm

Prior requirements:

Participation in the course "Phylogeny inference and applications", or any course dealing with combinatorial optimization is helpful but not necessary.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 10

Prabhav Kalaghatgi

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Computer-aided Drug Design - Methods and Application

LV: 60101711

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Andrea Volkamer

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 26.04.2021 18:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

More details will be discussed on Thursday, April 26th, 9-11:30 am, Charité, Mitte.

Additional information

For more information see: AG Volkamer - Teaching

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Andrea Volkamer

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Module: Applied Sequence Analysis (0262cB3.10)

Applied Sequence Analysis

LV: 19400313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Sandro Andreotti

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.2.1

Akt: 29.04.2021 18:00

Mon, 12:00 - 16:00 (Virtueller Raum 35)

General Professional Skills

ABV Bioinformatik (0261a_m30)

Module: Legal Aspects of Computer Science (0159cA2.4)

Basics of Data Protection Law

LV: 19307201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Philip Scholz

Lecture

Submod: 0159cA2.4.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 15)

Description

Content

The lecture is to provide the students with a first structured overview of the German and European Data Protection Law based on the EU General Data Protection Regulation (GDPR). Furthermore, current topics on data protection are being discussed in depth.

Overview of the topics

Historiy of data protection and privacy
European and constitutional legal background
Legislative framework: General Data Protection Regulation, Federal Data Protection Act, sector-specific data protection law
Basic concepts and scope (e.g. personal data)
Principles relating to processing of personal data and lawfulness of processing (e.g. consent)
Rights of the data subject (e.g. right of access, right to be forgotten)
Data protection by design and by default, security of processing, data protection impact assessment
Enforcement of data protection law: supervisory system, sanctions
Focal points: big data, profiling, social networks, smart video surveillance, processing in the context of employment

References

Material:

Konferenz der Datenschutzbeauftragten des Bundes und der Länder, Kurzpapiere zur Datenschutz-Grundverordnung, https://www.lfd.niedersachsen.de/startseite/dsgvo/anwendung_dsgvo_kurzpapiere
DatSchR: Datenschutzrecht, Gesetzestexte, 12. Auflage, Beck-Text im dtv 2020.

Literaturhinweise:

P. Schantz/H.A. Wolff, Das neue Datenschutzrecht – Datenschutz-Grundverordnung und Bundesdatenschutzgesetz in der Praxis, C.H. Beck 2017
Laue/Kremer, Das neue Datenschutzrecht in der betrieblichen Praxis, Handbuch, Nomos 2. Aufl. 2019
Kühling/Klar/Sackmann, Datenschutzrecht, Lehrbuch/Studienliteratur, C.F. Müller 4. Aufl. 2018
S. Jandt/R. Steidle, Datenschutz im Internet, Rechtshandbuch zu DSGVO und BDSG, Nomos 2018
A. Roßnagel (Hrsg.), Das neue Datenschutzrecht – Europäische Datenschutz-Grundverordnung und deutsche Datenschutzgesetze, Nomos 2018
S. Simitis/G. Hornung/I. Spiecker gen. Döhmann (Hrsg.), Datenschutzrecht: DSGVO mit BDSG, Großkommentar, Nomos 2019
J. Kühling / B. Buchner, Datenschutz-Grundverordnung, Bundesdatenschutzgsetz: DSGVO/BDSG, Kommentar, C.H. Beck 2. Auflage 2018
Th. Hoeren, Internetrecht (Skript, Stand März 2018), 6. Kapitel: Datenschutzrecht, Universität Münster (http://www.uni-muenster.de/Jura.itm/hoeren/lehre/materialien/materialien-zum-internetrecht)

Additional information

The exact date will be announced.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 15

Philip Scholz

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Practice seminar for Data Privacy

LV: 19307202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Philip Scholz

Practice seminar

Submod: 0159cA2.4.2

Akt: 06.04.2021 14:00

Wed, 18:00 - 19:00 (Virtueller Raum 15)

Module: Planning, Implementing and Analysing a Tutorial in Computer Science (0159cA2.5)

Planning, Realisation and Analysis of a Tutorial

LV: 19302613

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0159cA2.5.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Description

Content

In a preparatory colloquium, current teaching methods and advising for tutors are presented and discussed. This colloquium is specifically for students, which particularly want to guide exercise sessions as a tutor for the mathematics and computer science students. An interview with the selection committee will take place even during the holidays, in which will be decided about the suitability as a tutor.

After successful aptitude assessment a tutorial about a subjects of a lecture of the first four semesters bachelor study, should be prepare, expose, documented and analyzed.

References

Seifert, J. W.: Visualisieren Präsentieren Moderieren. GABAL Verlag, 16. Auflage 2001

Additional information

Time and location by appointment.

Additional appointments

Appointment series

Module: System Administration (0159cA2.7)

System Administration

LV: 19302201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Rolf Dietze

Lecture

Submod: 0159cA2.7.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Mon, 08:00 - 20:00 (T9/046 Seminarraum)

Sat, 08:00 - 20:00 (T9/046 Seminarraum)

Description

shell scripting from the viewpoint of system administration
planning and setting up a computer system while taking availability and maintainability into consideration (RAS-conditions)
redundancy in networking and storage
planning and setting up a redundant storage system (Raid-technologies and management)
system administration, security and user management, accounting and logging
managing configuration files and documentation
backups - strategies and technologies
planning and realization of networkwide services and resources (e.g. file services, print services, network information services)
implementation on different platforms (AIX, Solaris)
partitioning, virtualization and resource management on modern systems supporting logical partitioning
virtualization and resource management at the operating systems level (workload partitions, zones, jails)
qualitative comparison of partitioning and virtualization techniques on PowerPC and Sparc based UNI*-systems.
delegation of administration tasks with rolebased access (RBAC)
ethical and legal aspects when dealing with administrative privileges,
special aspects and procedures when dealing with personal information and security clearances when dealing with vital systems

At the beginning of the class, we will refresh the necessary knowledge to participate in the practical exercises and we will set up a working environment in the context of the administration of a heterogeneous computer network. Previous experience is desirable.

Additional information

The class will be taught as a block course. Details will be announced in due time.

Additional appointments

Appointment series

T9/046 Seminarraum

Rolf Dietze

einmal, ab 20.09.2021, 08:00 - 20:00 (15 Termine)

T9/046 Seminarraum

Rolf Dietze

einmal, ab 18.09.2021, 08:00 - 20:00 (4 Termine)

Internship for System Administration

LV: 19302230

a.SAP verarbeitet

3 SWS

No lecturers

Internship

Submod: 0159cA2.7.2

Akt: 06.04.2021 14:00

Module: General Professional Skills III (subject-related) (5 CP) (0261aA1.23)

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19213510

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 29.03.2021 20:00

Description

Bitte beachten Sie die für das Proseminar zusammengestellten allgemeinen Informationen unter https://box.fu-berlin.de/s/EnnbH2g257bJF8a

Im Zentrum des Seminars steht die Erarbeitung und Wiederentdeckung der Lebensgeschichten und des Wirken einiger bedeutender Mathematikerinnen und Informatikerinnen im 19. und 20. Jahrhundert. Betrachtet werden z.B. das Leben und Werk von Sophie Germaine (1776-1831), Ada Lovelace (1815-1852), Sonja Kovalevskaya (1850-1891), Emmy Noether (1882-1935), Ruth Moufang (1905-1977), Grace Murray Hopper (1906-1992) und weiterer Wissenschaftlerinnen.

Im Seminar geht es nicht darum, diese Frauen als Ausnahmeerscheinung hervorzuheben, denn dies würde sie lediglich auf ihren Exotinnenstatus festschreiben. Es geht vielmehr um eine historische Kontextualisierung deren Leben und Werk. Dies ermöglicht nicht nur eine exemplarische Auseinandersetzung mit gesellschaftlichen wie fachkulturellen Inklusions- und Exklusionsprozessen entlang der Kategorie Geschlecht, sondern auch die Entwicklung neuer Sichtweisen auf die tradierte Kulturgeschichte beider Disziplinen. Das Seminar basiert auf dem Ansatz eines forschenden oder entdeckenden Lernens, d.h. die Studierenden werden selbständig in Gruppenarbeiten einzelne Seminarthemen vorbereiten und präsentieren. Diese Präsentationen werden dann im Seminar diskutiert. Durch den Einsatz von Beobachtungsbögen soll zudem eine Feedbackkultur erprobt werden, die im späteren Berufsalltag im Umgang mit Schüler*innen und/oder Kolleg*innen hilfreich ist.

Additional appointments

Appointment series

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19234810

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Anina Mischau

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 14.06.2021 18:00

Mon, 14:00 - 18:00 (Virtueller Raum 23)

Description

The seminar focuses on the development and rediscovery of the life stories and the work of some important mathematicians and computer scientists in the 19th and 20th centuries. The life and work of Sophie Germaine (1776-1831), Ada Lovelace (1815-1852), Sonja Kovalevskaya (1850-1891), Emmy Noether (1882-1935), Ruth Moufang (1905-1977), Grace Murray Hopper (1906-1992) and other female scientists are examined.

The seminar is not about highlighting these women as an exception, because it would only set them on their exotic status. Rather, it is about a historical contextualization of their life and work. This not only enables an exemplary examination of social and cultural inclusion and exclusion processes along the gender category, but also the development of new perspectives on the traditional cultural history of both disciplines. The seminar is based on the approach of researching or discovering learning, i.e. the students will independently prepare and present individual seminar topics in group work. These presentations will then be discussed in the seminar. Through the use of observation sheets, a feedback culture is also to be tested that will be helpful in dealing with pupils and/or colleagues in later professional life.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 23

Anina Mischau

einmal, ab 19.04.2021, 14:00 - 18:00 (7 Termine)

Module: Berufspraktikum (0261aA2.1)

Bioinformatics Internship

LV: 19402433

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Professional Internship

Submod: 0261aA2.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Module: Principles of Business Administration (0105cA4.1)

Principles of Business Administration (GPP)

LV: 10120611

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

Seminar

Submod: 0105cA4.1.1

Akt: 15.04.2021 12:00

Tue, 10:00 - 12:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 12:00 - 14:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 14:00 - 16:00 (Online - zeitABhängig)

Description

Zu den Kommentaren der Veranstaltung

Additional appointments

Appointment series

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Module: Principles of Marketing (0105cA4.2)

Marketing-Grundlagen (ABV)

LV: 10120711

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Gunnar Mau

Manuel Schild

Benedikt Alberternst

Seminar

Submod: 0105cA4.2.1

Akt: 09.03.2021 14:00

Mon, 08:00 - 12:00 (Online - zeitUNabhängig)

Module: E-Business (0105cA4.3)

E-Business (ABV)

LV: 10121011

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Alexa Danelski

Fabian Rappert

Seminar

Submod: 0105cA4.3.1

Akt: 13.04.2021 16:00

Wed, 14:00 - 18:00 (Online - zeitABhängig)

Module: Principles of Business Administration (0105dA4.1)

Principles of Business Administration (GPP)

LV: 10120611

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

Seminar

Submod: 0105cA4.1.1

Akt: 15.04.2021 12:00

Tue, 10:00 - 12:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 12:00 - 14:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 14:00 - 16:00 (Online - zeitABhängig)

Description

Zu den Kommentaren der Veranstaltung

Additional appointments

Appointment series

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Module: Principles of Marketing (0105dA4.2)

Marketing-Grundlagen (ABV)

LV: 10120711

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Gunnar Mau

Manuel Schild

Benedikt Alberternst

Seminar

Submod: 0105cA4.2.1

Akt: 09.03.2021 14:00

Mon, 08:00 - 12:00 (Online - zeitUNabhängig)

Module: E-Business (0105dA4.3)

E-Business (ABV)

LV: 10121011

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Alexa Danelski

Fabian Rappert

Seminar

Submod: 0105cA4.3.1

Akt: 13.04.2021 16:00

Wed, 14:00 - 18:00 (Online - zeitABhängig)

Module: Funpreneur Competition - Launching a Student Company (0105dA4.6)

Gründung eines studentischen Unternehmens - Funpreneur-Wettbewerb

LV: 10123312

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Martin Gersch

Janina Sundermeier

Natalie Mahlert

Project Seminar

Submod: 0105dA4.6.1

Akt: 26.03.2021 12:00

Mon, 12:00 - 14:00 (Online - zeitABhängig)

ABV Bioinformatik (für Studierende, die nach der BSc STO/PO 2012 studieren) (0261b_m30)

Module: Principles of Business Administration (0105dA4.1)

Principles of Business Administration (GPP)

LV: 10120611

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

Seminar

Submod: 0105cA4.1.1

Akt: 15.04.2021 12:00

Tue, 10:00 - 12:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 12:00 - 14:00 (Online - zeitABhängig)

Tue, 14:00 - 16:00 (Online - zeitABhängig)

Description

Zu den Kommentaren der Veranstaltung

Additional appointments

Appointment series

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Online - zeitABhängig

Martin Gersch

Fabian Rappert

Moritz Kleinaltenkamp

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Module: Principles of Marketing (0105dA4.2)

Marketing-Grundlagen (ABV)

LV: 10120711

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Gunnar Mau

Manuel Schild

Benedikt Alberternst

Seminar

Submod: 0105cA4.2.1

Akt: 09.03.2021 14:00

Mon, 08:00 - 12:00 (Online - zeitUNabhängig)

Module: E-Business (0105dA4.3)

E-Business (ABV)

LV: 10121011

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Martin Gersch

Alexa Danelski

Fabian Rappert

Seminar

Submod: 0105cA4.3.1

Akt: 13.04.2021 16:00

Wed, 14:00 - 18:00 (Online - zeitABhängig)

Module: Funpreneur Competition - Launching a Student Company (0105dA4.6)

Gründung eines studentischen Unternehmens - Funpreneur-Wettbewerb

LV: 10123312

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Martin Gersch

Janina Sundermeier

Natalie Mahlert

Project Seminar

Submod: 0105dA4.6.1

Akt: 26.03.2021 12:00

Mon, 12:00 - 14:00 (Online - zeitABhängig)

Module: Project Management in the Software Area (0261bA1.1)

Seminar for Software Project Management (Functional Genomics)

LV: 19402511

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 20.04.2021 22:00

Software Project Management (Functional Genomics)

LV: 19402513

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 20.04.2021 22:00

Description

Integrative analysis of next generation sequencing (NGS) data
One of the research questions in bioinformatics and regulatory genomics is to understand the principles of transcriptional regulation. Transcription factors are the main players of gene regulation. Another aspect accounts for the open chromatin which enables the binding of the transcription factors and the RNA Polymerase II. There are several experimental techniques which can determine the interaction of the regulatory proteins and the DNA, such as ChIP-seq. Combinatorical analysis of several experiments help us to understand the interplay of all these factors on regulatory elements in the genome. We will analyze ChIP-seq and RNA-seq data in various cell lines to model the TF binding and histone modifications across the genome with respect to gene expression of the neighbouring genes. Afterwards, we develop a statistical method to combine these data in an appropriate way. We will use both implemented tools and our own scripts to obtain suitable results. Students will work in groups of 3 and present their work at the end of the seminar.

Additional information

The allocation of seats takes place every year in February.

Additional appointments

Appointment series

Seminar for Software Project Management (OpenMS)

LV: 19403411

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Software Project Management (OpenMS)

LV: 19403413

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar for Software Project Management (Workflows)

LV: 19404311

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Software Project Management (Workflows)

LV: 19404313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (Preißner)

LV: 60100311

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Projektmanagement im Softwarebereich (Preißner)

LV: 60100313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (AI for Health)

LV: 60102811

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 20.03.2021 00:00

Projektmanagement im Softwarebereich (AI for Health)

LV: 60102813

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 20.03.2021 00:00

Seminar zu Projektmanagement im Softwarebereich (Bioinformatische Aufklärung monogener Krankheiten)

LV: 60102911

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Projektmanagement im Softwarebereich (Bioinformatische Aufklärung monogener Krankheiten)

LV: 60102913

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Module: Legal Aspects of Computer Science (0159cA2.4)

Basics of Data Protection Law

LV: 19307201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Philip Scholz

Lecture

Submod: 0159cA2.4.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 15)

Description

Content

Overview of the topics

Historiy of data protection and privacy
European and constitutional legal background
Legislative framework: General Data Protection Regulation, Federal Data Protection Act, sector-specific data protection law
Basic concepts and scope (e.g. personal data)
Principles relating to processing of personal data and lawfulness of processing (e.g. consent)
Rights of the data subject (e.g. right of access, right to be forgotten)
Data protection by design and by default, security of processing, data protection impact assessment
Enforcement of data protection law: supervisory system, sanctions
Focal points: big data, profiling, social networks, smart video surveillance, processing in the context of employment

References

Material:

Konferenz der Datenschutzbeauftragten des Bundes und der Länder, Kurzpapiere zur Datenschutz-Grundverordnung, https://www.lfd.niedersachsen.de/startseite/dsgvo/anwendung_dsgvo_kurzpapiere
DatSchR: Datenschutzrecht, Gesetzestexte, 12. Auflage, Beck-Text im dtv 2020.

Literaturhinweise:

P. Schantz/H.A. Wolff, Das neue Datenschutzrecht – Datenschutz-Grundverordnung und Bundesdatenschutzgesetz in der Praxis, C.H. Beck 2017
Laue/Kremer, Das neue Datenschutzrecht in der betrieblichen Praxis, Handbuch, Nomos 2. Aufl. 2019
Kühling/Klar/Sackmann, Datenschutzrecht, Lehrbuch/Studienliteratur, C.F. Müller 4. Aufl. 2018
S. Jandt/R. Steidle, Datenschutz im Internet, Rechtshandbuch zu DSGVO und BDSG, Nomos 2018
A. Roßnagel (Hrsg.), Das neue Datenschutzrecht – Europäische Datenschutz-Grundverordnung und deutsche Datenschutzgesetze, Nomos 2018
S. Simitis/G. Hornung/I. Spiecker gen. Döhmann (Hrsg.), Datenschutzrecht: DSGVO mit BDSG, Großkommentar, Nomos 2019
J. Kühling / B. Buchner, Datenschutz-Grundverordnung, Bundesdatenschutzgsetz: DSGVO/BDSG, Kommentar, C.H. Beck 2. Auflage 2018
Th. Hoeren, Internetrecht (Skript, Stand März 2018), 6. Kapitel: Datenschutzrecht, Universität Münster (http://www.uni-muenster.de/Jura.itm/hoeren/lehre/materialien/materialien-zum-internetrecht)

Additional information

The exact date will be announced.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 15

Philip Scholz

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Practice seminar for Data Privacy

LV: 19307202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Philip Scholz

Practice seminar

Submod: 0159cA2.4.2

Akt: 06.04.2021 14:00

Wed, 18:00 - 19:00 (Virtueller Raum 15)

Module: Planning, Implementing and Analysing a Tutorial in Computer Science (0159cA2.5)

Planning, Realisation and Analysis of a Tutorial

LV: 19302613

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0159cA2.5.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Description

Content

After successful aptitude assessment a tutorial about a subjects of a lecture of the first four semesters bachelor study, should be prepare, expose, documented and analyzed.

References

Seifert, J. W.: Visualisieren Präsentieren Moderieren. GABAL Verlag, 16. Auflage 2001

Additional information

Time and location by appointment.

Additional appointments

Appointment series

Module: System Administration (0159cA2.7)

System Administration

LV: 19302201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Rolf Dietze

Lecture

Submod: 0159cA2.7.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Mon, 08:00 - 20:00 (T9/046 Seminarraum)

Sat, 08:00 - 20:00 (T9/046 Seminarraum)

Description

shell scripting from the viewpoint of system administration
planning and setting up a computer system while taking availability and maintainability into consideration (RAS-conditions)
redundancy in networking and storage
planning and setting up a redundant storage system (Raid-technologies and management)
system administration, security and user management, accounting and logging
managing configuration files and documentation
backups - strategies and technologies
planning and realization of networkwide services and resources (e.g. file services, print services, network information services)
implementation on different platforms (AIX, Solaris)
partitioning, virtualization and resource management on modern systems supporting logical partitioning
virtualization and resource management at the operating systems level (workload partitions, zones, jails)
qualitative comparison of partitioning and virtualization techniques on PowerPC and Sparc based UNI*-systems.
delegation of administration tasks with rolebased access (RBAC)
ethical and legal aspects when dealing with administrative privileges,
special aspects and procedures when dealing with personal information and security clearances when dealing with vital systems

Additional information

The class will be taught as a block course. Details will be announced in due time.

Additional appointments

Appointment series

T9/046 Seminarraum

Rolf Dietze

einmal, ab 20.09.2021, 08:00 - 20:00 (15 Termine)

T9/046 Seminarraum

Rolf Dietze

einmal, ab 18.09.2021, 08:00 - 20:00 (4 Termine)

Internship for System Administration

LV: 19302230

a.SAP verarbeitet

3 SWS

No lecturers

Internship

Submod: 0159cA2.7.2

Akt: 06.04.2021 14:00

Module: General Professional Skills III (subject-related) (5 CP) (0261bA2.10)

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19213510

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 29.03.2021 20:00

Description

Bitte beachten Sie die für das Proseminar zusammengestellten allgemeinen Informationen unter https://box.fu-berlin.de/s/EnnbH2g257bJF8a

Additional appointments

Appointment series

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19234810

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Anina Mischau

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 14.06.2021 18:00

Mon, 14:00 - 18:00 (Virtueller Raum 23)

Description

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 23

Anina Mischau

einmal, ab 19.04.2021, 14:00 - 18:00 (7 Termine)

Module: Professional Internship (0261bA3.1)

Bioinformatics Internship

LV: 19402433

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Professional Internship

Submod: 0261aA2.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Gesamtes Lehrangebot der Bioinformatik

Gesamtes Lehrangebot der Bioinformatik (E61a)

Module: Gesamtes Lehrangebot der Bioinformatik (E61aA1.1)

Mentoring for International Students

LV: 19000246

a.Publiziert

2 SWS

No lecturers

Mentoring

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 07.09.2021 05:43

Welcome for Undergraduate Students of Computer Sciences

LV: 19000370

a.Publiziert

0 SWS

Lutz Prechelt

Begrüßungs- und Abschlussveranstaltung

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 09.04.2021 15:49

Pseudo-Course: Bachelor-, Master- and PHD-Colloquium

LV: 19000450

a.Publiziert

0 SWS

N.N.

Colloquium

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 15.09.2021 13:28

Description

Reservierungen für Verteidigungen, Sitzungen und Bau- oder IT-Arbeiten sind als "Reservierung zu einer Lehrveranstaltung" zu behandeln.

Bitte halten Sie sich ausnahmlos daran, damit diese Reservierung nicht noch einmal händisch von Fr. Üzel in Evento übernommen werden müssen, sondern über die Exportfunktion zu myCampus übertragen werden können!

Für folgende Anlässe von Raumreservierungen wurden Pseudo-Lehrveranstaltungen geschaffen:

Verteidigungen von BSc, MSc, PhD: "Pseudo-LV 19000450 Bachelor-/Master- und Promotionskolloquium" Tragen Sie bitte den betreuenden Dozenten als Veranstalter ein.
Sitzungen von BKIs, Gremien, Institutsrat, Prüfungsausschüssen: "Pseudo-LV 19000699 Gremiumssitzungen"
Bauarbeiten und IT-Arbeiten: "Pseudo-LV 19000799 Bau- und IT-Arbeiten"

Additional appointments

Bachelor-, Master- und Promotionskolloquium

A3/019 Seminarraum

N.N.

04.05.2021 08:00 - 09:00

Wahlen

A3/Hs 001 Hörsaal

N.N.

18.05.2021 09:30 - 16:00

Pseudo-LV: Bachelor-, Master- und Promotionskolloquium

A6/SR 032 Seminarraum

N.N.

19.08.2021 10:00 - 14:00

Pseudo-LV: Bachelor-, Master- und Promotionskolloquium

T9/051 Seminarraum

N.N.

20.09.2021 10:00 - 12:00

Disputation Katharina Klost

T9/Gr. Hörsaal

N.N.

21.09.2021 15:00 - 19:00

Pseudo-LV: Bachelor-, Master- und Promotionskolloquium

A6/SR 032 Seminarraum

N.N.

23.09.2021 11:00 - 12:00

Appointment series

Mentoring

LV: 19000546

a.Publiziert

0 SWS

No lecturers

Mentoring

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 20.03.2021 19:48

Pseudo-Course: Board Meeting

LV: 19000699

a.Publiziert

0 SWS

N.N.

Miscellaneous

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 01.09.2021 14:58

Wed, 09:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Description

Reservierungen für Verteidigungen, Sitzungen und Bau- oder IT-Arbeiten sind als "Reservierung zu einer Lehrveranstaltung" zu behandeln.

Für folgende Anlässe von Raumreservierungen wurden Pseudo-Lehrveranstaltungen geschaffen:

Verteidigungen von BSc, MSc, PhD: "Pseudo-LV 19000450 Bachelor-/Master- und Promotionskolloquium" Tragen Sie bitte den betreuenden Dozenten als Veranstalter ein.
Sitzungen von BKIs, Gremien, Institutsrat, Prüfungsausschüssen: "Pseudo-LV 19000699 Gremiumssitzungen"
Bauarbeiten und IT-Arbeiten: "Pseudo-LV 19000799 Bau- und IT-Arbeiten"

Additional appointments

Gremiumssitzungen

T9/051 Seminarraum

N.N.

18.03.2021 19:30 - 20:00

Appointment series

T9/SR 005 Übungsraum

N.N.

täglich, ab 08.09.2021, 09:00 - 18:00 (3 Termine)

Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211901

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

Lecture

Submod: 0260bA2.4.1

Akt: 19.05.2021 14:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 05)

Description

Inhalt:

Die Auswahl der behandelten numerischen Verfahren enthält Polynominterpolation, Newton-Cotes-Formeln zur numerische Integration und Euler-Verfahren für lineare Differentialgleichungen.

Additional information

Studierende der Mathematik (Monobachelor und Lehramt) und Bioinformatik, sowie Numerikinteressierte aus Physik, Informatik und anderen Natur- und Geisteswissenschaften.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 05

Ralf Kornhuber

Christof Schütte

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Computer-oriented Mathematics II

LV: 19211902

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Lasse Hinrichsen-Bischoff

Practice seminar

Submod: 0260bA2.4.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 04)

Wed, 10:00 - 12:00 (A3/019 Seminarraum)

Wed, 08:00 - 10:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 08)

Wed, 16:00 - 18:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 15)

Thu, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 06)

Mon, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 04)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

A3/019 Seminarraum

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 08

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

A3/Hs 001 Hörsaal

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 04

Lasse Hinrichsen-Bischoff

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19213510

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 29.03.2021 20:00

Description

Bitte beachten Sie die für das Proseminar zusammengestellten allgemeinen Informationen unter https://box.fu-berlin.de/s/EnnbH2g257bJF8a

Additional appointments

Appointment series

Women in the History of Mathematics and Computer Science

LV: 19234810

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Anina Mischau

Proseminar

Submod: 0261aA1.23.1

Akt: 14.06.2021 18:00

Mon, 14:00 - 18:00 (Virtueller Raum 23)

Description

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 23

Anina Mischau

einmal, ab 19.04.2021, 14:00 - 18:00 (7 Termine)

Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301201

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Günther Rothe

Lecture

Submod: 0086bA3.1.1

Akt: 07.07.2021 14:00

Wed, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Mon, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Uwe Schöning, Theoretische Informatik kurzgefasst, 5. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, 2008
John E. Hopcroft, Rajeev Motwani, Jeffrey D. Ullman, Einführung in die Automatentheorie, Formale Sprachen und Komplexität, Pearson Studium, 3. Auflage, 2011
Ingo Wegener: Theoretische Informatik - Eine algorithmenorientierte Einführung, 2. Auflage, Teubner, 1999
Michael Sipser, Introduction to the Theory of Computation, 2nd ed., Thomson Course Technology, 2006
Wegener, Kompendium theoretische Informatik - Eine Ideensammlung, Teubner 1996

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 02

Günther Rothe

07.07.2021 10:00 - 12:00

Nachklausur (Räume Hs 1b und 2 und KL 29/111 Habelschwerdter Allee 45 / Rostlaube)

Günther Rothe

06.10.2021 10:00 - 12:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 03

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Foundations of Theoretical Computer Science

LV: 19301202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Günther Rothe

Practice seminar

Submod: 0086bA3.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 025/026 Seminarraum)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/046 Seminarraum)

Thu, 12:00 - 14:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Mon, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/051 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 06)

Fri, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/053 Seminarraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (A7/SR 031)

Tue, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Thu, 14:00 - 16:00 (A7/SR 031)

Tue, 16:00 - 18:00 (T9/051 Seminarraum)

Fri, 16:00 - 18:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Wed, 16:00 - 18:00 (T9/049 Seminarraum)

Wed, 14:00 - 16:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A6/SR 025/026 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/046 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 12:00 - 14:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 06

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/053 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A6/SR 032 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Günther Rothe

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

T9/049 Seminarraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Günther Rothe

einmal, ab 14.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Database Systems

LV: 19301501

a.SAP verarbeitet

3 SWS

Agnès Voisard

Lecture

Submod: 0086bA3.3.1

Akt: 08.07.2021 00:09

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Tue, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 03)

Description

Content

Project: the topics are deepened in an implementation project for student groups.

References

Alfons Kemper, Andre Eickler: Datenbanksysteme - Eine Einführung, 5. Auflage, Oldenbourg 2004
R. Elmasri, S. Navathe: Grundlagen von Datenbanksystemen, Pearson Studium, 2005

Additional information

Requirements

ALP 1 - Functional Programming
ALP 2 - Object-oriented Programming
ALP 3 - Data structures and data abstractions
OR Informatik B

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 05

Agnès Voisard

13.07.2021 14:00 - 16:00

Appointment series

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 15.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Agnès Voisard

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Practice seminar for Database systems

LV: 19301502

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Nicolas Lehmann

Practice seminar

Submod: 0086bA3.3.2

Akt: 12.03.2021 16:00

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 02)

Fri, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 10)

Fri, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 01)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Thu, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 13)

Tue, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 03)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 01)

Mon, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 18)

Wed, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 14)

Fri, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 15)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 02

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 10

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 13

Nicolas Lehmann

einmal, ab 15.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 03

Nicolas Lehmann

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 18

Nicolas Lehmann

einmal, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 14

Nicolas Lehmann

einmal, ab 14.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 15

Nicolas Lehmann

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Computer Science B

LV: 19302101

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Max Willert

Lecture

Submod: 0260cA1.2.1

Akt: 14.09.2021 12:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 02)

Wed, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 02)

Description

The class focuses on:

Fundations of programming: imperative and object-oriented programming
Algorithms and data structures: design and implementation of data structures
theory of algorithms

We use C++ as an implementation language.

Target Audience

Students with Computer Science as a minor concentration and students of bioinformatics.

References

Goodrich, Tamassia: Data Structures and Algorithms in C++
Stroustrup: Die C++ Programmiersprache
Cormen, Leiserson, Rivest, Stein: Introduction to Algorithms
Kleinberg, Tardos: Algorithm Design
Schöning: Algorithmen - kurz gefasst

Additional appointments

Klausur

Virtueller Raum 02

Max Willert

21.07.2021 08:00 - 10:00

Appointment series

Virtueller Raum 02

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 02

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Practice seminar for Computer Science B

LV: 19302102

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Max Willert

Practice seminar

Submod: 0260cA1.2.2

Akt: 30.03.2021 14:00

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/046 Seminarraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/046 Seminarraum)

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/049 Seminarraum)

Thu, 08:00 - 10:00 (T9/053 Seminarraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Tue, 10:00 - 12:00 (T9/051 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (T9/SR 006 Seminarraum)

Thu, 08:00 - 10:00 (T9/051 Seminarraum)

Tue, 10:00 - 12:00 (T9/049 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Wed, 12:00 - 14:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Thu, 10:00 - 12:00 (T9/049 Seminarraum)

Additional appointments

Appointment series

T9/SR 006 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/046 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/046 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/053 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

T9/051 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A6/SR 032 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/SR 006 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/051 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 13.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/SR 005 Übungsraum

Max Willert

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

T9/049 Seminarraum

Max Willert

einmal, ab 15.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Applied Sequence Analysis

LV: 19400313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Sandro Andreotti

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.2.1

Akt: 29.04.2021 18:00

Mon, 12:00 - 16:00 (Virtueller Raum 35)

Bioinformatics Research Internship

LV: 19400432

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Research Internship

Submod: 0262bA1.6.1

Akt: 17.06.2021 12:00

Computational Systems Biology

LV: 19400813

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Heike Siebert

Jana Wolf

Lab Seminar

Submod: 0262bB2.4.1

Akt: 17.03.2021 13:00

Thu, 10:00 - 14:00 (T9/051 Seminarraum)

Mathematics for Bioinformaticians II

LV: 19402201

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

Lecture

Submod: 0260cA2.2.1

Akt: 30.08.2021 16:00

Tue, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 01)

Wed, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 01)

Description

number systems: from natural numbers to real numbers, completeness property of the reals
polynomials: roots of polynomials, polynomial interpolation, rational functions
special functions: exponential function, logarithm, trigonometric functions
complex numbers: exponential function for complex numbers, complex roots
convergence of sequences and series, convergence of functions, continuous functions
differential calculus: derivative of a function, interpretations and applications of the derivative
intergral calculus: definite and indefinite integrals, fundamental theorem of calculus, applications
power series
Taylor series
basics of differential calculus for multivariate functions: partial derivative, gradient, Jacobi matrix
solution of simple differential equations

References

Kurt Meyberg, Peter Vachenauer: Höhere Mathematik 1, Springer-Verlag, 6.Auflage 2001
Dirk Hachenberger: Mathematik für Informatiker, Pearson 2005
Gerhard Berendt: Mathematische Grundlagen der Informatik, Band 2, B.I.-Wissenschaftsverlag; 1990
Thomas Westermann: Mathematik für Ingenieure mit Maple 1, Springer-Verlag, 4.Auflage 2005

Additional information

Target group:

Students of Bioinformatics (BSc, second semester)

Requirements:

Mathematik für Bioinformatiker I

Additional appointments

Nachklausur

Hs A (Raum B.006, 200 Pl.)

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

13.10.2021 10:00 - 12:00

Appointment series

Virtueller Raum 01

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

einmal, ab 13.04.2021, 14:00 - 16:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 01

Alexander Bockmayr

Heike Siebert

einmal, ab 14.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Practice seminar for Mathematics for Bioinformaticians II

LV: 19402202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Heike Siebert

Practice seminar

Submod: 0260cA2.2.2

Akt: 09.04.2021 18:00

Fri, 12:00 - 14:00 (A3/Hs 001 Hörsaal)

Fri, 12:00 - 14:00 ()

Thu, 08:00 - 10:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Fri, 10:00 - 12:00 (Virtueller Raum 07)

Additional appointments

Appointment series

A3/Hs 001 Hörsaal

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

A6/SR 031 Seminarraum

Heike Siebert

einmal, ab 15.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Virtueller Raum 07

Heike Siebert

einmal, ab 16.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Bioinformatics Internship

LV: 19402433

a.SAP verarbeitet

0 SWS

No lecturers

Professional Internship

Submod: 0261aA2.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar for Software Project Management (Functional Genomics)

LV: 19402511

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 20.04.2021 22:00

Software Project Management (Functional Genomics)

LV: 19402513

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 20.04.2021 22:00

Description

Additional information

The allocation of seats takes place every year in February.

Additional appointments

Appointment series

Journal Club Computational Biology

LV: 19402911

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Knut Reinert

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 16:00 (T9/053 Seminarraum)

Description

Content:

Please sign up on the KVV pages (open "Site Browser" and look forJournal Club).

References

aktuelle Publikationen aus der Forschung

Additional information

Open for:

Master and PhD students

Additional appointments

Appointment series

T9/053 Seminarraum

Knut Reinert

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

Seminar for Software Project Management (OpenMS)

LV: 19403411

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Software Project Management (OpenMS)

LV: 19403413

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar for Software Project Management (Workflows)

LV: 19404311

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0261bA1.1.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Software Project Management (Workflows)

LV: 19404313

a.SAP verarbeitet

4 SWS

No lecturers

Lab Seminar

Submod: 0261bA1.1.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Computational Meta-Omics

LV: 19404811

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Thilo Muth

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Fri, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 08)

Description

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 08

Thilo Muth

einmal, ab 16.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Lecture

Submod: 0262bB1.3.1

Akt: 27.04.2021 18:00

Mon, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Description

Content:

Topics from the following areas are considered in depth:

- Network structure analysis

- Graphical modeling

- Modeling of biochemical networks using standard differential equations

- Discrete modeling of regulatory networks

- Constraint-based modeling

- Stochastic and hybrid modeling

References

wird in der Veranstaltung bekanntgegeben.

Additional appointments

Appointment series

T9/SR 005 Übungsraum

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

einmal, ab 12.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Practice seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405202

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Practice seminar

Submod: 0262bB1.3.2

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 10:00 - 12:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Seminar for Complex Systems in Bioinformatics

LV: 19405211

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Alexander Bockmayr

Martin Vingron

Seminar

Submod: 0262bB1.3.3

Akt: 27.04.2021 18:00

Fri, 12:00 - 14:00 (T9/SR 005 Übungsraum)

Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405301

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Lecture

Submod: 0262bB1.5.1

Akt: 16.06.2021 20:00

Tue, 12:00 - 14:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Description

Goals:

Some examples of subjects that will be more deeply discussed:

Paradigms for approximative, semiglobal alignments (read mapping)
Methods for genomic assembly and metagenomic assembly
Methods for the identification of genetic variants (SNVs, SNPs, CNVs) - algorithmic problems of quantifying expession using NGS data

For further information go to: https://mycampus.imp.fu-berlin.de/portal

Additional appointments

Appointment series

A6/SR 032 Seminarraum

Torsten Semmler

einmal, ab 13.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Practice seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405302

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Practice seminar

Submod: 0262bB1.5.2

Akt: 05.05.2021 18:00

Thu, 14:00 - 16:00 (Virtueller Raum 30)

Seminar for Advanced Algorithms in Bioinformatics

LV: 19405311

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Torsten Semmler

Seminar

Submod: 0262bB1.5.3

Akt: 16.06.2021 18:30

Fri, 14:00 - 16:00 (A6/SR 032 Seminarraum)

Ethics and Policy Questions

LV: 19405413

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Jens Peter Fürste

Lab Seminar

Submod: 0262cB1.3.1

Akt: 26.04.2021 14:00

Thu, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Data Science in the Life Sciences

LV: 19405606

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Eirini Ntoutsi

Seminar-style instruction

Submod: 0590aB2.1.1

Akt: 24.03.2021 20:00

Tue, 08:00 - 12:00 (Virtueller Raum 01)

Description

The focus will be on the following topics:

After successful completion of this course, participants are able to evaluate, plan and conduct investigations in the life sciences using common methods.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 01

Eirini Ntoutsi

einmal, ab 13.04.2021, 08:00 - 12:00 (14 Termine)

Projectseminar for Data Science in the Life Sciences

LV: 19405612

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Katinka Wolter

Project Seminar

Submod: 0590aB2.1.2

Akt: 24.03.2021 20:00

Tue, 14:00 - 18:00 (T9/Gr. Hörsaal)

Bioinformatics

LV: 19406001

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Tim Conrad

Lecture

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Thu, 08:00 - 10:00 (Virtueller Raum 31)

Practice seminar Bioinformatics

LV: 19406002

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Tim Conrad

Practice seminar

Submod: E61aA1.1.1

Akt: 06.04.2021 14:00

Mon, 16:00 - 18:00 (A6/SR 031 Seminarraum)

Tue, 16:00 - 18:00 (A3/019 Seminarraum)

Wed, 08:00 - 10:00 (A7/SR 031)

Description

In der Übung werden die Vorlesungsinhalte aus der Vorlesung 21609a vertieft.

Additional appointments

Appointment series

A6/SR 031 Seminarraum

Tim Conrad

wöchentlich, ab 12.04.2021, 16:00 - 18:00 (13 Termine)

A3/019 Seminarraum

Tim Conrad

wöchentlich, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

A7/SR 031

Tim Conrad

wöchentlich, ab 14.04.2021, 08:00 - 10:00 (14 Termine)

Large-scale phylogeny inference

LV: 19406111

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Prabhav Kalaghatgi

Seminar

Submod: 0262bB3.1.5

Akt: 06.04.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 (Virtueller Raum 10)

Description

Description:

(i) Tree modification operations

(ii) Numerical optimization of hidden Markov models on trees

(ii) Topological correspondence between minimum spanning trees and phylogenetic trees

(iii) Evolutionary placement algorithm

Prior requirements:

Participation in the course "Phylogeny inference and applications", or any course dealing with combinatorial optimization is helpful but not necessary.

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 10

Prabhav Kalaghatgi

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

LV: 21601a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

Lecture

Submod: 0260cA3.3.1

Akt: 20.07.2021 16:00

Wed, 12:00 - 14:00 ()

Description

Additional information for students

Vertonte ppt und/oder Videokonferenz zur regulären Zeit. Entspricht Molekularbiologie und Biochemie I für Bioinformatiker.

Additional appointments

Klausur: 21601 - Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

10.08.2021 10:00 - 11:00

Nachklausur: 21601 - Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

13.09.2021 10:00 - 11:00

Appointment series

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 14.04.2021, 12:00 - 14:00 (14 Termine)

Übungen zur Biochemie I - Grundlagen der Biochemie

LV: 21601b

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

Practice seminar

Submod: 0260cA3.3.2

Akt: 12.04.2021 12:00

Wed, 10:00 - 12:00 ()

Wed, 08:00 - 10:00 ()

Wed, 10:00 - 12:00 ()

Wed, 08:00 - 10:00 ()

Description

Additional information

Additional information for students

Videokonferenz zur regulären Zeit.

Additional appointments

Appointment series

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 10:00 - 12:00 (13 Termine)

Markus Wahl

Florian Heyd

Helge Ewers

einmal, ab 21.04.2021, 08:00 - 10:00 (13 Termine)

Molekularbiologie und Biochemie III

LV: 21699a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

Lecture

Submod: 0260cA3.5.1

Akt: 29.03.2021 14:00

Fri, 10:00 - 12:00 ()

Additional information

Additional information for students

Vorlesung für Studierende der Bioinformatik

Additional appointments

Appointment series

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

einmal, ab 16.04.2021, 10:00 - 12:00 (14 Termine)

Übungen zu Molekularbiologie und Biochemie III

LV: 21699b

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

Practice seminar

Submod: 0260cA3.5.2

Akt: 29.03.2021 14:00

Wed, 14:00 - 16:00 ()

Additional information

Additional information for students

Übungen zu 21699a für Studierende der Bioinformatik

Additional appointments

Appointment series

Sigmar Stricker

Sutapa Chakrabarti

einmal, ab 21.04.2021, 14:00 - 16:00 (13 Termine)

V Biodiversität und Evolution/ Biodiversity and Evolution (V)

LV: 23779a

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0262bB1.1.1

Akt: 09.04.2021 18:00

Ü Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (Ü)

LV: 23779b

a.SAP verarbeitet

1 SWS

No lecturers

Practice seminar

Submod: 0262bB1.1.2

Akt: 19.03.2021 20:00

S Biodiversität und Evolution / Biodiversity and Evolution (S)

LV: 23779c

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0262bB1.1.3

Akt: 22.03.2021 18:00

Statistics II for biosciences

LV: 60100101

a.SAP verarbeitet

4 SWS

Jochen Kruppa

Lecture

Submod: 0260cA2.6.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Mon, 14:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Description

PCA/Cluster/Klassifizierung
Faktoranalyse
Missing Values
Einführung: Nichtparametrik, Ausreißer
Multiples Testen /Posthoc-Tests
Regression - Diagnostische Studien mit der Vertiefung logistische Regression & ROC
Regression - Überlebenszeitanalyse
Regression - Variablenselektion
Regression - Varianzanalyse (mit Messwiederholung)
Regression - Gemischte Modelle

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 31

Jochen Kruppa

einmal, ab 12.04.2021, 14:00 - 18:00 (13 Termine)

Practice seminar for Statistics II for biosciences

LV: 60100102

a.SAP verarbeitet

2 SWS

Jochen Kruppa

Practice seminar

Submod: 0260cA2.6.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 12)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 31)

Tue, 16:00 - 18:00 (Virtueller Raum 35)

Additional appointments

Appointment series

Virtueller Raum 12

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 31

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Virtueller Raum 35

Jochen Kruppa

einmal, ab 13.04.2021, 16:00 - 18:00 (14 Termine)

Medical Physiology

LV: 60100201

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Lecture

Submod: 0260cA3.7.1

Akt: 09.03.2021 22:00

Seminar for Medical Physiology

LV: 60100211

a.SAP verarbeitet

2 SWS

No lecturers

Seminar

Submod: 0260cA3.7.2

Akt: 09.03.2021 22:00

Bachelor's programme in Bioinformatics

Bachelor's programme in Bioinformatics (2010 study regulations) (0260b_k150)

Module: Computerorientierte Mathematik II (0260bA2.4)

Inhalt:

Module: Fundamentals of Theoretical Computer Science (0086bA3.1)

Contents:

Module: Database Systems (0086bA3.3)

Content

Requirements

Bachelor's programme in Bioinformatics (2012 study regulations) (0260c_k150)

Module: Computer Science B (0260cA1.2)

Contents

Target Audience

Module: Mathematik für Bioinformatiker II (0260cA2.2)

Contents:

Target group:

Requirements:

Module: Computerorientierte Mathematik II (0260cA2.4)

Inhalt:

Module: Statistics for Biosciences II (0260cA2.6)

Module: Molecular Biology and Biochemistry I (0260cA3.3)

Module: Molecular Biology and Biochemistry III (0260cA3.5)

Module: Medizinische Physiologie (0260cA3.7)

Module: Database Systems (0260cA4.1)

Content

Requirements

Module: Fundamentals of Theoretical Computer Science (0260cA4.2)

Contents:

Master's programme in Bioinformatics

Master Bioinformatik (StO/PO 2012) (0262b_MA120)

Module: Research Lab (0262bA1.6)

Module: Biodiversität und Evolution (0262bB1.1)

Module: Netzwerkanalyse (0262bB1.3)

Module: Sequenzanalyse (0262bB1.5)

Module: Current Issues in Cell Physiology (0262bB2.1)

Module: Angewandte Sequenzanalyse (0262bB2.2)

Goals:

Module: Rechnergestützte Systembiologie (0262bB2.4)

Content:

Target group:

Module: Forschungsmodul A (0262bB3.1)

Content:

Open for:

Module: Forschungsmodul B (0262bB3.2)

Content:

Open for:

Master Bioinformatik (SPO 2019) (0262c_MA120)

Module: Complex Systems in Bioinformatics (0262cB1.1)

Module: Ethics and Policy Questions (0262cB1.3)

Module: Research Internship (0262cB1.4)

Module: Current research topics in Complex Systems (0262cB1.5)

Module: Human Evolution (0262cB1.7)

Module: Current topics in cell-physiology (0262cB1.11)

Module: Computational Systems Biology (0262cB1.12)

Content:

Target group:

Module: Data Science in the Life Sciences (0590aB2.1)

Module: Current research topics in Data Science in Life Sciences (0262cB2.5)

Module: Complex Data Analysis in Physiology (0262cB2.8)

Module: Advanced Biometrical Methods (0262cB2.18)

Module: Advanced Algorithms for Bioinformatics (0262cB3.1)

Module: Biodiversity and Evolution (0262cB3.5)

Module: Current research topics in Advanced Algorithms (0262cB3.7)

Content:

Open for:

Module: Applied Sequence Analysis (0262cB3.10)

Goals:

General Professional Skills

ABV Bioinformatik (0261a_m30)

Module: Legal Aspects of Computer Science (0159cA2.4)

Content

Overview of the topics

Module: Planning, Implementing and Analysing a Tutorial in Computer Science (0159cA2.5)

Content

Module: System Administration (0159cA2.7)

Contents

Module: General Professional Skills III (subject-related) (5 CP) (0261aA1.23)

Module: Berufspraktikum (0261aA2.1)

Module: Principles of Business Administration (0105cA4.1)

Module: Principles of Marketing (0105cA4.2)