Ziele:
Die Studentinnen und Studenten erlangen ein tieferes Versta¨ndnis fu¨r grundlegende algorithmische Konzepte im Bereich der Analyse genomischer Sequenzen vor dem Hintergrund aktueller Forschungsrichtungen der Bioinformatik und Biotechnologie. Sie verstehen verschiedene Paradigmen zur approximativen Suche, sie wissen, unter welchen Voraussetzungen bestimmte Algorithmen anderen vorzuziehen sind, und ko¨nnen wissenschaftliche Publikationen auf dem Gebiet entsprechend einscha¨tzen.
Es werden vertieft Themen aus beispielsweise folgenden Gebieten behandelt:
- Paradigmen fu¨r approximative, semiglobale Alignments (read mapping)
- Methoden zur Genomassemblierung und Metagenomassemblierung
- Methoden zum Bestimmen genetischer Variationen (SNVs, SNPs, CNVs)
- Algorithmische Probleme bei der Quantifizierung mit Hilfe von NGS Daten
Alle weiteren Informationen im KVV: https://kvv.imp.fu-berlin.de/portal/